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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004729`

染色体: Chr01 坐标: 65461649-65464185 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004729`
名称	SmilChr01G004729
描述	60S ribosomal protein L7-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65461649 - 65464185 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005072`
GeneID	`131005072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005072`
原始查询	`LOC131005072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L7-1
产物	60S ribosomal protein L7-1
Arabidopsis	`AT1G80750` (AT1G80750) Ribosomal protein L30/L7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844414] identity=53.9; qcov=1.04; evalue=7.48e-86; confidence=high
Rice	`Os08g0542100` - identity=53; qcov=1.01; evalue=2.02e-84; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00327 (Ribosomal_L30); PF08079 (Ribosomal_L30_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057787854.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057787854.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057787854.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787854.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65463076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C27
`Chr1:65463335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C36,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787854.1

247 aa

124

247

Ribosomal_L30_N

Ribosomal_L30

PF08079 Ribosomal_L30_N 14-75 aa PF00327 Ribosomal_L30 89-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787854.1`	Pfam	`PF08079`	Ribosomal_L30_N	Domain	14	75	1.7e-10	41.8	Ribosomal L30 N-terminal domain
`XP_057787854.1`	Pfam	`PF00327`	Ribosomal_L30	Domain	89	139	3.6e-17	62.6	Ribosomal protein L30p/L7e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931871.1
AAAACAGTCCGGCTCATTTGTTTTATTCACATTATATTATATTAAAATATCCGAAATTTCAAGACTACAATAGCTATTTGAAGTTGGGGGTTTATATTAGGGTTTTGACAGTCGATGCAATCTCTCTCTCTTTCCTTCCGTAGCAGGACTCGCGTCTGCGAATTCTTGTATTTCCTCTGAATTGATTGTTTTGCTACCAATTATTACCTCTCTTATTTGCACTATCGCCATTTTCATCGAATAAAATACACACATGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005072
ATGGCGGCAGAGGAGGCGGCCCCAGCGGCTCTGAATTACATACCGGAGGTAGTGCTGAAGAAGAGGAAGACCAATGATCAGTGGGCAGTTAGAAGAAAACTCCAGCAGCAGGAGAGGGCTAAGCGTCTGAAAACCGGTAATTTTATCATAAAAAAGCCCGAGCAATTCATTCGAGAATATCGCGATAAGGAATTGGACATAGTTCAAATGAAGAGTAGGGGGAAGCAAATCAGACCCGCATCGGTGACACCCGAATCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787854.1
MAAEEAAPAALNYIPEVVLKKRKTNDQWAVRRKLQQQERAKRLKTGNFIIKKPEQFIREYRDKELDIVQMKSRGKQIRPASVTPESNLLFVIRIRGKNDMHPKTRKILYSLRLRKIRTGVFVKASAGMMEMLQKVEPYVTYGYPNVKSVKDLIYKKGVVRVGKERIPLTDNNIVEQELGKHNIICIEDIVNEVVSVGSHFKAVNSFLCPFVLNNPEKALQGKKKRFEDGGDSGNRKDQINELISKMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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