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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004769`

染色体: Chr01 坐标: 65858151-65862059 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004769`
名称	SmilChr01G004769
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65858151 - 65862059 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005109`
GeneID	`131005109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005109`
原始查询	`LOC131005109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=27.1; qcov=1.02; evalue=1.03e-82; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=25.9; qcov=1.01; evalue=8.99e-72; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787903.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787903.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787903.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787903.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65858767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:65858977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:65859000`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	49	A25,A3,B103,B106,B112,B117,B121,B128,B129,B13,B18,B19,B20,B22,B25,B29,B51,B54,B55,B6,B65,B70,B71,B8,B83,B87,B90,B92,B94,C10,C11,C12,C17,C18,C2,C27,C3,C31,C32,C49,C59,C61,C63,C69,C70,C77,C79,D4,D8
`Chr1:65859004`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A25,A3,B103,B106,B112,B117,B128,B129,B13,B18,B19,B20,B22,B25,B54,B55,B6,B65,B70,B71,B8,B81,B83,B87,B90,B92,C11,C12,C18,C2,C27,C3,C31,C49,C59,C61,C69,C70,C77,C79,D4,D8
`Chr1:65859005`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A25,A3,B103,B106,B112,B117,B128,B129,B13,B18,B19,B20,B22,B25,B54,B55,B6,B65,B70,B71,B8,B81,B83,B87,B90,B92,C11,C12,C18,C2,C27,C3,C31,C49,C59,C61,C63,C69,C70,C77,C79,D4,D8
`Chr1:65859007`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B121,B29,B51,B94,C17,C32
`Chr1:65859011`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A25,A3,B103,B106,B112,B117,B128,B129,B13,B18,B19,B20,B22,B25,B54,B55,B6,B65,B70,B71,B8,B81,B83,B87,B90,B92,C1,C10,C11,C12,C18,C2,C27,C3,C31,C48,C49,C59,C61,C63,C69,C7,C70,C77,C79,D4,D8
`Chr1:65859047`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B121,B51,B94,C17,C32
`Chr1:65859047`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B121,B51,B94,C17,C32
`Chr1:65859177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:65859188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:65859230`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787903.1

882 aa

441

882

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-91 aa PF00931 NB-ARC 169-330 aa PF23559 WHD_DRP 422-490 aa PF23598 LRR_14 560-819 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787903.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	91	1.3e-15	57.9	Rx N-terminal domain
`XP_057787903.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	169	330	3.9e-39	134.7	NB-ARC domain
`XP_057787903.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	422	490	2.1e-18	66.8	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057787903.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	560	819	9.9e-12	45.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931920.1
TAACACTAACATTATTTTGTTTTACAAATGACACTAACACTATATCGAAATGATACTAACACTTGACATTCGAGTAGGATAATTTATTCGGGTCAGGATTCGCGTCGGGTATTCGGGTCACCATCTAAGTGTACATGAGATTTTGTGTGTGTTAAAATAGGAAAAGATAGTTAATTGAAGGAGATATTAAAATGAAAATAGGAATACTAACTGTTGAATGCATAAAAAAAGTACTACTAGTACAATGAACTTTCCCAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005109
ATGGCGGAGGCGGCAGTGACATTCTTGCTGGAGCAGCTGAAGGAGGTGGTGGTCGGGTACGCGGATCTGATCACCGGAGCGGAGAGGGAGTTCGATCAGCTGAACCACGACCTTGATTTACTCAAGGCGTTTCTGAAGGAGATGGCGGAGAAGAAGAAGAAGGATAAAATGTTGAAATTACTGGAGAGGCGGATAAGGAAAGTGGTGTACGAGGTGGAAGACACCATCGACACTTGCTTGACCAAGGCTATTGAAGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787903.1
MAEAAVTFLLEQLKEVVVGYADLITGAEREFDQLNHDLDLLKAFLKEMAEKKKKDKMLKLLERRIRKVVYEVEDTIDTCLTKAIEAKARNSLRRRIGIKSVSLAKEVRAVRDEKVVPLFEDTGKFANMEKIAHGAGDGAGEEPPTHSSKRDIPIRQNRVVGFDEEEATITGYLKERRDKLDVISIVGIPGQGKTTLAWKIYENEPICFHFPIRIWVYISQVFNSRDVFLQILKKFIPSQDTSSLNDDELAQTVRACLEKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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