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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004774`

染色体: Chr01 坐标: 65926426-65928756 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004774`
名称	SmilChr01G004774
描述	manganese-dependent ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65926426 - 65928756 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005113`
GeneID	`131005113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005113`
原始查询	`LOC131005113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	manganese-dependent ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase-like
产物	manganese-dependent ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase-like
Arabidopsis	`AT4G24730` (AT4G24730) manganese-dependent ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828575] identity=66.1; qcov=0.962; evalue=3.34e-150; confidence=high
Rice	`Os07g0688000` (OsNRT3.2) - identity=64.2; qcov=0.997; evalue=3.99e-160; confidence=high
GO	GO:0008663 (2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase activity); GO:0030145 (manganese ion binding); GO:0047631 (ADP-ribose diphosphatase activity); GO:0047734 (CDP-glycerol diphosphatase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057787910.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057787910.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057787910.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057787910.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65926785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,C38,C75,C86
`Chr1:65926786`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B101,C45
`Chr1:65926786`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B101,C45
`Chr1:65926849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B65,B66,C8
`Chr1:65927016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D10
`Chr1:65927178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B45,B49,C50,C62
`Chr1:65927446`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B24
`Chr1:65927446`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B24
`Chr1:65927464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787910.1

319 aa

160

319

Metallophos

PF00149 Metallophos 20-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787910.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	20	264	3.7e-12	47.8	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931927.1
CCGGCGATGTTAGATACAATTACATTCCAACTCGTGAACGGAGTTGGGTTCAACTCAAATTCGTAGAAAGAATTTGATCTTCGATAAAGATTATCCAAATCGTTTCCTAGTATAAATCATTCTATTGGAATCAAATTTAGGTAACCGACCACAGCACGCGGCATATATTGAGGGAACAACGTCGTTCGACGCCTTCATATAATATATACATATACATTACATACACATATATTTCGACGCTGCAGCCACCTTGTCTCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005113
ATGGGTTATGCAGAAGGGCTTTTCACTGCACAAGGAGAAAAGCCTCTAGCTTCCTTGGGGGTAATATCCGATGTTCAGTATGCTGACATCCCAGATGGCAGCTCATTTCTTGGTGTTCCTCGCTATTACAGGCACAGCCTCCATGTGCTGCAAAGAGCAGTCAAGAAATGGAACGAAGAAAAGGTGAACTTTGTGATCAATTTTGGGGACATAGTCGATGGATACTGCCCCAAAGATCAATCTCTGGCTGCTGTCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787910.1
MGYAEGLFTAQGEKPLASLGVISDVQYADIPDGSSFLGVPRYYRHSLHVLQRAVKKWNEEKVNFVINFGDIVDGYCPKDQSLAAVKNIVNEFSLFNGPIYHMIGNHCLYNLSRETLLPMLNIPTTDLHAYYDFSPVPEYRFVVLDGYDISAIGWPDDHPNAVKAADFLWERNPNSDKNSPNGLLGRDRRFLMFNGAVGKEQLEWLDGVLQDATCSNQKVVICCHLPLDPQASSNEALLWNYNEVMDLIHRYDCVKVCLAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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