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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004795`

染色体: Chr01 坐标: 66181464-66183723 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004795`
名称	SmilChr01G004795
描述	60S ribosomal protein L23a-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66181464 - 66183723 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005131`
GeneID	`131005131`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005131`
原始查询	`LOC131005131`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L23a-like
产物	60S ribosomal protein L23a-like
Arabidopsis	`AT3G55280` (RPL23AB) ribosomal protein L23AB [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824694] identity=87.1; qcov=1; evalue=9.81e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0348700` (OsRPL23A) - identity=82.3; qcov=0.948; evalue=3.93e-69; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00276 (Ribosomal_L23); PF03939 (Ribosomal_L23eN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005131

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057787929.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057787929.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787929.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787929.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66182775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:66182940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:66183072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B78
`Chr1:66183103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:66183497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B13,B63,C15,C21
`Chr1:66183498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B13,B63,C15,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787929.1

155 aa

155

Ribosomal_L23eN

Ribosomal_L23

PF03939 Ribosomal_L23eN 14-64 aa PF00276 Ribosomal_L23 74-135 aa

XP_057787930.1

155 aa

155

Ribosomal_L23eN

Ribosomal_L23

PF03939 Ribosomal_L23eN 14-64 aa PF00276 Ribosomal_L23 74-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787929.1`	Pfam	`PF03939`	Ribosomal_L23eN	Family	14	64	2.3e-18	66.7	Ribosomal protein L23, N-terminal domain
`XP_057787929.1`	Pfam	`PF00276`	Ribosomal_L23	Family	74	135	1.5e-13	51.7	Ribosomal protein L23
`XP_057787930.1`	Pfam	`PF03939`	Ribosomal_L23eN	Family	14	64	2.3e-18	66.7	Ribosomal protein L23, N-terminal domain
`XP_057787930.1`	Pfam	`PF00276`	Ribosomal_L23	Family	74	135	1.5e-13	51.7	Ribosomal protein L23

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931946.1
TCTTCATTATTGGGACGGATGAGTATTTAACACGAAAAGAAAACCCTAACCCTAATTAACTACTTGTCCCCCCATTCAGCCCACGCCGCACACCATCTCGTCGCTTCCATCCGCGGTGAAGAAAGTAAAAAGTTGCATTAGGGTTACTTCCGTTTCAAATGGCTCCAGCTAAAGGTGATACAGGTAAGAAGTCAGATGCCAAGGCTCAAGCCTTAAAGGCGGCCAAGGCTGTAAAAGCAGGTGCAACAACCTTTAAGAAG...

XM_057931947.1
ACTACTTGTCCCCCCATTCAGCCCACGCCGCACACCATCTCGTCGCTTCCATCCGCGGTGAAGAAAGTAAGCAACTTCTTTTCCATTCTTCACTCTGCATCTCTTAACCGCCACCGTCAAGTAAAAAGTTGCATTAGGGTTACTTCCGTTTCAAATGGCTCCAGCTAAAGGTGATACAGGTAAGAAGTCAGATGCCAAGGCTCAAGCCTTAAAGGCGGCCAAGGCTGTAAAAGCAGGTGCAACAACCTTTAAGAAGAAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005131
ATGGCTCCAGCTAAAGGTGATACAGGTAAGAAGTCAGATGCCAAGGCTCAAGCCTTAAAGGCGGCCAAGGCTGTAAAAGCAGGTGCAACAACCTTTAAGAAGAAGGCCAAGAAAATACGCACTAAAGTTACCTTCTATCGGCCGAAGACATTGACAAAGGAAAGGAATCCCAAGTATCCTCGTATTAGTGCTGTTCCTCGCAACAAACTTGACCACTACCAGATTCTTAAATACCCTCTCACCACAGAGTCTGCAATGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787929.1
MAPAKGDTGKKSDAKAQALKAAKAVKAGATTFKKKAKKIRTKVTFYRPKTLTKERNPKYPRISAVPRNKLDHYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKAAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_057787930.1
MAPAKGDTGKKSDAKAQALKAAKAVKAGATTFKKKAKKIRTKVTFYRPKTLTKERNPKYPRISAVPRNKLDHYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKAAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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