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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004802`

染色体: Chr01 坐标: 66234482-66236984 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004802`
名称	SmilChr01G004802
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66234482 - 66236984 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005139`
GeneID	`131005139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005139`
原始查询	`LOC131005139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like
产物	28 kDa ribonucleoprotein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G50250` (CP31B) chloroplast RNA-binding protein 31B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835090] identity=54.8; qcov=1.01; evalue=5.53e-90; confidence=high
Rice	`Os09g0565200` - identity=71.5; qcov=0.648; evalue=3.27e-91; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057787938.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057787938.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787938.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787938.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66234682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:66234747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:66235967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B109,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787938.1

287 aa

144

287

RRM_1

PF00076 RRM_1 112-181 aa PF00076 RRM_1 204-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787938.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	112	181	1.7e-43	147.0	RNA recognition motif
`XP_057787938.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	204	274	1.7e-43	147.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931955.1
TTGTATTTAATAAATAGGAATAATAGTACCCTTATCTTCATTCTTGAAACCCTTTCAAGACCTACCCATTCACCACAAACCCTTCTAAACCCCTTCCATCCTCTTCTCCTCTCTATCTCTACGATTTCTGCAAATACAATGGCTTTTGCAGCTAATACTGCGTTGATTTCAAGCCCGACGCTCTTCACTCCATCAAAAATCTCATATTCTCACCCTTATCTCTCCATTCCGTATAAACCCGCGAAATTCCAGCTTTACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005139
ATGGCTTTTGCAGCTAATACTGCGTTGATTTCAAGCCCGACGCTCTTCACTCCATCAAAAATCTCATATTCTCACCCTTATCTCTCCATTCCGTATAAACCCGCGAAATTCCAGCTTTACTGCAAGCCCATATCCTCACTTTCTCTCACTTCTCTATTCTATATCGGAAGGAAGGAGAAAAGCGTTGTGTCGGCTCTAGGTGACGATGTTCCTGCAGTTCTTGAAGGAATTGAGGGGAATTTGAGCTGGGATGCGGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787938.1
MAFAANTALISSPTLFTPSKISYSHPYLSIPYKPAKFQLYCKPISSLSLTSLFYIGRKEKSVVSALGDDVPAVLEGIEGNLSWDAAVTDESGVEGEESEGGFVVEPPEGAKVYVGNLPFDVDSERLGHLFEQAGVVEIAEVIYDRMTGNSRGFGFVTMSTVEEAEKAVELFSRYDLDGRFLTVNIAAPKGSRPERAPREPGHRIYVGNLPWTVDSDRLEELFSEHGVVVSARVVSDRETGRSRGFGFVEMSTESEMNDAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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