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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004818`

染色体: Chr01 坐标: 66354225-66356865 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004818`
名称	SmilChr01G004818
描述	sabinene synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66354225 - 66356865 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005154`
GeneID	`131005154`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005154`
原始查询	`LOC131005154`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sabinene synthase 1, chloroplastic-like
产物	sabinene synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G25810` (AT3G25810) Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822173] identity=42; qcov=0.978; evalue=9.41e-151; confidence=medium
Rice	`Os07g0218200` (TPS3) - identity=31.8; qcov=0.893; evalue=5.2e-74; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005154

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057787954.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787954.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057787954.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787954.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66354343`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A1,A11,A2,A20,A24,A5,A6,A7,A8,B100,B101,B107,B109,B112,B114,B119,B121,B122,B123,B132,B134,B135,B137,B138,B15,B16,B18,B24,B26,B29,B3,B30,B32,B33,B38,B39,B44,B45,B48,B50,B54,B56,B59,B6,B67,B68,B69,B71,B76,B86,B9,B94,B96,C1,C12,C14,C21,C22,C24,C25,C33,C34,C37,C4,C40,C41,C49,C51,C53,C54,C55,C56,C60,C63,C64,C66,C67,C70,C74,C77,C79,C86,C87,D1
`Chr1:66354346`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	84	A1,A11,A2,A20,A24,A5,A6,A7,A8,B100,B101,B107,B109,B112,B114,B119,B121,B122,B123,B132,B134,B135,B137,B138,B15,B16,B18,B24,B26,B29,B3,B30,B32,B33,B38,B39,B44,B45,B48,B50,B54,B56,B59,B6,B67,B68,B69,B71,B76,B86,B9,B94,B96,C1,C12,C14,C21,C22,C24,C25,C33,C34,C37,C4,C40,C41,C49,C51,C53,C54,C55,C56,C60,C63,C64,C66,C67,C70,C74,C77,C79,C86,C87,D1
`Chr1:66354347`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A10,A11,A20,A21,A23,A5,A7,A9,B101,B103,B104,B107,B113,B114,B115,B126,B127,B131,B133,B136,B17,B20,B24,B27,B33,B43,B45,B46,B47,B53,B57,B60,B67,B72,B79,B80,B88,B93,B95,C10,C18,C21,C22,C3,C33,C37,C39,C44,C47,C5,C58,C60,C7,C72,C74,C85,D1,D11,D5
`Chr1:66354740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C83
`Chr1:66355226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr1:66355346`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B107,B41,C46,C66,C68,C82
`Chr1:66355348`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B107,B41,C46,C66,C68,C82
`Chr1:66355891`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr1:66355891`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B66
`Chr1:66356040`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A23,B102,B26,B32,B54,B56,B58,B64,B68,B75,B83,B96,B99,C31,C41,C42,C51,C53,C64,C66,C71,C9,D8
`Chr1:66356105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B50,C1,C87
`Chr1:66356178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787954.1

598 aa

299

598

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 62-245 aa PF03936 Terpene_synth_C 302-540 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 342-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787954.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	62	245	1.5e-45	156.0	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057787954.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	302	540	2e-89	299.8	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057787954.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	342	541	4.6e-60	203.5	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931971.1
AGAGAGCAAAGGTTGATCTCAAAATGTCTATCTCTATATTGCAAATGGCGATTCCTAGCAGCCCCGCTTATAATCATCTCCATAAATTACATAGCAGCAAGTCTTCAAAACTTTCTAGTAGCTGCCTCCGCCTGCGTTGCTCCTCCCAACTAAATGCTGATCAACTCCCAATCCAACGACGATCTGGAAACTACAGTCCTTCCCGTTGGGATGTCGACTATATTCAATCACTCCAAAGTGATTATAAGGAAGAAAGGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005154
ATGTCTATCTCTATATTGCAAATGGCGATTCCTAGCAGCCCCGCTTATAATCATCTCCATAAATTACATAGCAGCAAGTCTTCAAAACTTTCTAGTAGCTGCCTCCGCCTGCGTTGCTCCTCCCAACTAAATGCTGATCAACTCCCAATCCAACGACGATCTGGAAACTACAGTCCTTCCCGTTGGGATGTCGACTATATTCAATCACTCCAAAGTGATTATAAGGAAGAAAGGCATGCGAGAAGGACTAGTGAGCTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787954.1
MSISILQMAIPSSPAYNHLHKLHSSKSSKLSSSCLRLRCSSQLNADQLPIQRRSGNYSPSRWDVDYIQSLQSDYKEERHARRTSELIMQVKKMLEKETDPTRQLELIDELQRLGLSEHFHNEFKEILNSGYLENKYYKNGEIITQEAGKKNLYSTALAFRLLRQHGFQVAQEVFECFKNEEGEFKASLRDDTRGLLQLYEASFMLTEGENTLDIAREFATKILQEKLVNDEIDDNNLITWIRHSLEIPIHWSVERVNTSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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