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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004820`

染色体: Chr01 坐标: 66387773-66391211 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004820`
名称	SmilChr01G004820
描述	cineole synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66387773 - 66391211 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005156`
GeneID	`131005156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005156`
原始查询	`LOC131005156`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cineole synthase 1, chloroplastic-like
产物	cineole synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G25810` (AT3G25810) Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822173] identity=44.3; qcov=0.921; evalue=3.75e-151; confidence=medium
Rice	`Os02g0121700` (OsTPS3) - identity=29.5; qcov=0.929; evalue=9.97e-74; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057787955.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787955.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057787955.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787955.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66387856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:66387863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:66387877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:66387881`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	71	A10,A11,A15,A5,A9,B100,B110,B114,B117,B118,B123,B124,B127,B128,B131,B134,B135,B136,B137,B14,B2,B22,B24,B25,B29,B39,B41,B43,B44,B48,B49,B52,B61,B63,B66,B67,B70,B72,B76,B8,B80,B86,B91,B93,B94,B96,C12,C16,C19,C25,C27,C28,C30,C34,C38,C43,C45,C47,C52,C56,C58,C6,C75,C77,C80,C83,C86,D1,D10,D11,D2
`Chr1:66387884`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	63	A10,A15,A5,A9,B100,B110,B114,B117,B118,B124,B127,B128,B131,B134,B135,B137,B14,B2,B24,B25,B29,B39,B41,B43,B44,B48,B49,B52,B61,B63,B66,B67,B72,B76,B8,B80,B86,B93,B94,B96,C12,C16,C25,C27,C28,C30,C34,C38,C43,C45,C47,C52,C56,C58,C6,C75,C77,C80,C83,C86,D10,D11,D2
`Chr1:66387912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B73
`Chr1:66388384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C86
`Chr1:66388543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C63
`Chr1:66388635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C19
`Chr1:66388673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B23,C5,C80
`Chr1:66388771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B95,C74
`Chr1:66388773`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C47,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787955.1

595 aa

298

595

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 58-241 aa PF03936 Terpene_synth_C 299-538 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 340-538 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787955.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	58	241	3.6e-46	158.0	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057787955.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	299	538	2.8e-84	282.9	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057787955.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	340	538	1.7e-58	198.4	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931972.1
CAAGAGAGCAAAGGTTGATCTCAAAATGTCTATCTCTATATTGCAAATGGCGATTCCTTATAATCATCTCCATAAATTACACAGCAGCAAGTCTTCAAAACTTTCTAGTAGCTGCCTCCGCCTGCGTTGCTCCTCCCAACTAAATGCTGATCAACTCCCAATCCCACGACGATCTGGAAACTACAGTCCTTCCCGTTGGGATGTCGACTATATTCAATCACTCCAAAGTGATTATAAGGAAGACAGGCATGTGAGAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005156
ATGTCTATCTCTATATTGCAAATGGCGATTCCTTATAATCATCTCCATAAATTACACAGCAGCAAGTCTTCAAAACTTTCTAGTAGCTGCCTCCGCCTGCGTTGCTCCTCCCAACTAAATGCTGATCAACTCCCAATCCCACGACGATCTGGAAACTACAGTCCTTCCCGTTGGGATGTCGACTATATTCAATCACTCCAAAGTGATTATAAGGAAGACAGGCATGTGAGAAGGGCTAGTGAGCTAATTATGCAAGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787955.1
MSISILQMAIPYNHLHKLHSSKSSKLSSSCLRLRCSSQLNADQLPIPRRSGNYSPSRWDVDYIQSLQSDYKEDRHVRRASELIMQVKKMLEKETDPTRQLELIDELQRLGLSEHFHNEFKEILNSGYLENKYYKNGEIITQEAGKKNLYSTALAFRLLRQHGFQVAQEVFECFKNEEGEFKASLRDDTRGLLQLYEASFLSTEGENTLDIAREFATKILQEKLVNDEIDDNNLLIWIRHSLEIPIHWSIERVNTSVWIDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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