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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004831`

染色体: Chr01 坐标: 66440004-66449582 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004831`
名称	SmilChr01G004831
描述	dynamin-related protein 3B
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66440004 - 66449582 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005168`
GeneID	`131005168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005168`
原始查询	`LOC131005168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynamin-related protein 3B
产物	dynamin-related protein 3B
Arabidopsis	`AT4G33650` (DRP3A) dynamin-related protein 3A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829506] identity=69.8; qcov=0.907; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0920400` (OsDRP3A) - identity=65.5; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N); PF01031 (Dynamin_M); PF01926 (MMR_HSR1); PF02212 (GED)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057787968.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057787968.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057787968.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057787968.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057787968.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66440403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,C86
`Chr1:66440408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B50
`Chr1:66440503`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C47,C83
`Chr1:66440503`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C47,C83
`Chr1:66440547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,C13,C17,C40,C61
`Chr1:66440627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:66441143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B52,B76,B8
`Chr1:66442009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:66442124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,C86
`Chr1:66442256`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	66	A1,A11,A19,A20,A25,A4,B102,B103,B104,B106,B107,B11,B112,B12,B120,B124,B134,B136,B137,B16,B17,B2,B21,B27,B41,B42,B43,B44,B5,B54,B56,B59,B65,B67,B69,B71,B8,B83,B84,B85,B90,B92,B94,B95,B96,C10,C14,C24,C3,C34,C43,C46,C49,C50,C52,C55,C56,C59,C72,C73,C81,C82,D10,D2,D4,D8
`Chr1:66442300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B136,B16,B35
`Chr1:66442358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787968.1

821 aa

410

821

MMR_HSR1

Dynamin_N

Dynamin_M

GED

PF01926 MMR_HSR1 46-202 aa PF00350 Dynamin_N 47-227 aa PF01031 Dynamin_M 235-520 aa PF02212 GED 651-739 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787968.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	46	202	1.1e-06	29.4	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057787968.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	47	227	1.4e-56	191.8	Dynamin family
`XP_057787968.1`	Pfam	`PF01031`	Dynamin_M	Family	235	520	4.2e-102	341.9	Dynamin central region
`XP_057787968.1`	Pfam	`PF02212`	GED	Family	651	739	7.6e-27	94.0	Dynamin GTPase effector domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931985.1
ATCGCTATTTTAAACGAATAACACGTAAGTGTTTATAATTAAAAAAAGAAAAAAAGACTAGCGCGGTGGCCGGTGCCGGGCCGGGATCCCCCATTCTCTGCGGTAAGAGTGTGTGTCAATGTTTGCTTGTGCGCTACGTGAAGGAGGAGGATCCTCGCGCAAGTTTCTCTCGCACACTCTTTCTCTCTCTAAAATCCTTACTATTTCAGACTCTGCTCTCATCCCCACCGCTCACACAATCCCCTAACTAGGGTTTTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005168
ATGACGGAGGTGAAATCGGCGGCGTCGAACGGCGGCTCGTCGGCGACGCCGTTTGGGAGCTCGGTTATACCCATAGCGAACAAACTGCAGGATATTTTCGCGCAGCTAGGAAGCCAGTCTACGATCGACTTGCCGCAGGTGGCGGTGGTCGGCAGCCAGAGCAGCGGCAAATCGAGTGTGTTGGAGGCGCTCGTAGGACGTGATTTTCTACCGCGTGGAAGTGACATCTGCACCCGCCGCCCGCTCACGCTGCAGCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787968.1
MTEVKSAASNGGSSATPFGSSVIPIANKLQDIFAQLGSQSTIDLPQVAVVGSQSSGKSSVLEALVGRDFLPRGSDICTRRPLTLQLHQRQRKADDEEEEWGEFLHLPGKKFFDFSGIRREIQAATEREAGGNKGVSDKPISLKIYSPNVLDITLVDLPGLTKVPVGDQPSDIETRIRNMITAVIKRESCLILAVTPANADLANSDALQMAQCVDPDGHRTIGVITKLDIMDRGTDARNFLLGKVVPLRLGYVGVVNRSQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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