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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004847`

染色体: Chr01 坐标: 66621550-66625582 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004847`
名称	SmilChr01G004847
描述	heat shock 70 kDa protein, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66621550 - 66625582 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005185`
GeneID	`131005185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005185`
原始查询	`LOC131005185`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat shock 70 kDa protein, mitochondrial
产物	heat shock 70 kDa protein%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G09590` (MTHSC70-2) mitochondrial HSO70 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830818] identity=83; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0774300` (OsISC23) - identity=83.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0031072 (heat shock protein binding); GO:0034620 (cellular response to unfolded protein); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085); GO:0051787 (misfolded protein binding); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00012 (HSP70); PF06723 (MreB_Mbl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057788002.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057788002.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057788002.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788002.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66621759`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C66
`Chr1:66621759`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C66
`Chr1:66621762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr1:66623068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:66623176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:66623421`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	140	A11,A14,A15,A16,A19,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B105,B107,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B122,B124,B127,B128,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B17,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B79,B8,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C26,C27,C28,C30,C33,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C44,C50,C51,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C74,C8,C82,C83,C84,C86,D10,D4,D5,D8,D9
`Chr1:66623426`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	142	A11,A14,A15,A16,A19,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B105,B107,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B122,B124,B127,B128,B13,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B17,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B79,B8,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C26,C27,C28,C30,C33,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C44,C50,C51,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C74,C77,C8,C82,C83,C84,C86,D10,D4,D5,D8,D9
`Chr1:66623429`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	141	A11,A14,A15,A16,A19,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B105,B107,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B122,B124,B127,B128,B13,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B17,B2,B22,B23,B26,B27,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B79,B8,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C26,C27,C28,C30,C33,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C44,C50,C51,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C74,C77,C8,C82,C83,C84,C86,D10,D4,D5,D8,D9
`Chr1:66623442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C64
`Chr1:66623442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:66623603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D1
`Chr1:66623995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B29,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788002.1

674 aa

337

674

HSP70

MreB_Mbl

PF00012 HSP70 52-644 aa PF06723 MreB_Mbl 182-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788002.1`	Pfam	`PF00012`	HSP70	Family	52	644	5.3e-276	917.3	Hsp70 protein
`XP_057788002.1`	Pfam	`PF06723`	MreB_Mbl	Family	182	418	1.6e-11	44.4	MreB/Mbl protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932019.1
ACCACATATATCTAGAACCTTCTGGGTGTATTAGTATTTCTTTTTCCTTTTTTCTAAACCTCAGCTATTTGTATCCGCCTCCCCTCCCCCAAAGCTCCTCATAAACCCTAAACCCTAGCGACCCAGGAGTGAACACTGCACACTCTTCATTTTTAATACAGCTCTCCGTTTCGATGGCGACCGCCGTCCTCCTCAGATCTCTCCGTCGCTCCGCCCCTATCTCTGCTTCCAGAATATTAGCTGGAAACACCAAACCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005185
ATGGCGACCGCCGTCCTCCTCAGATCTCTCCGTCGCTCCGCCCCTATCTCTGCTTCCAGAATATTAGCTGGAAACACCAAACCATCATATGCAGCCAGCAACAAGTGGGCAGGTCTTGTAAGGCCGTTCAGTACGAAACCCGCTGGAAATGATGTCATTGGCATCGACTTGGGTACCACAAATTCTTGTGTGTCTGTCATGGAGGGAAAGACTCCGAAAGTTATTGAGAATGCTGAGGGTGCTCGGACAACTCCATCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788002.1
MATAVLLRSLRRSAPISASRILAGNTKPSYAASNKWAGLVRPFSTKPAGNDVIGIDLGTTNSCVSVMEGKTPKVIENAEGARTTPSVVAFSPKGELLVGIPAKRQAVTNPTNTVFGTKRLIGRRFDDPQTQKEMKMVPYKIVRAPNGDAWVEANGQQYSPSQVGAFVLTKMKETAEDYLGKTVTKAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLDVQRIINEPTAAALSYGLNNKEGLVAVFDLGGGTFDISILEISNGVFEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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