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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004868`

染色体: Chr01 坐标: 66794216-66799552 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004868`
名称	SmilChr01G004868
描述	uncharacterized SmilChr01G004868
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66794216 - 66799552 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005206`
GeneID	`131005206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005206`
原始查询	`LOC131005206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kokopelli [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836492]; symbol=KPL; hit=AT5G63720; species=arabidopsis; confidence=low
产物	kokopelli [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836492]; symbol=KPL; hit=AT5G63720; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G63720` (KPL) kokopelli [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836492] identity=29.9; qcov=0.387; evalue=2.8e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28834 (KOKOPELLI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788025.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788025.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788025.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788025.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66794385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B52,B54,D10,D11
`Chr1:66794453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B114
`Chr1:66794484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A4,B127,B23,B37,B64,B78,C16,C17,C19,C27,C30,C31,C35,C36,C46,C53,C56,C74
`Chr1:66794554`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A18,A23,A24,B128,B135,B26,B3,B42,B43,B69,B9,C18,C22,C29,C44,C54,D5
`Chr1:66794588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C11,C40,C69
`Chr1:66794610`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D2
`Chr1:66794610`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D2
`Chr1:66794708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:66794714`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B103,B124,B19,B36,B98,C39
`Chr1:66794717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B124,B19,B36,B98
`Chr1:66794803`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A16,B6,B80,C20,C21,C44,C56
`Chr1:66794804`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A16,B6,B80,C20,C21,C44,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788025.1

811 aa

406

811

KOKOPELLI

PF28834 KOKOPELLI 1-197 aa PF28834 KOKOPELLI 520-786 aa

XP_057788026.1

811 aa

406

811

KOKOPELLI

PF28834 KOKOPELLI 1-197 aa PF28834 KOKOPELLI 520-786 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788025.1`	Pfam	`PF28834`	KOKOPELLI	Family	1	197	1.1e-25	91.8	KOKOPELLI
`XP_057788025.1`	Pfam	`PF28834`	KOKOPELLI	Family	520	786	1.1e-25	91.8	KOKOPELLI
`XP_057788026.1`	Pfam	`PF28834`	KOKOPELLI	Family	1	197	1.1e-25	91.8	KOKOPELLI
`XP_057788026.1`	Pfam	`PF28834`	KOKOPELLI	Family	520	786	1.1e-25	91.8	KOKOPELLI

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932043.1
TCCATTCTTCATTTTTAAAATAAGCCCATGAAATGAGCCCAAACCCTTCTATCTTCTTCTCCACTCACGCTGCCACGCACAGCACAAACTGCTCAATGCTCTCTCTCTCGGACTCTCGTTCAGCAATCGTCACAGCCGCTGCCGCGCACACCATCCTCTCCCTAGCCTCTCGCCCTCTGTTTTCCTTCATTTATCTCCTTCCCTCCTTCACGAATTCCGGCGAGATCCGCCATTTAACGTGGTGCTCTGCTGCACTTCTG...

XM_057932042.1
TCCATTCTTCATTTTTAAAATAAGCCCATGAAATGAGCCCAAACCCTTCTATCTTCTTCTCCACTCACGCTGCCACGCACAGCACAAACTGCTCAATGCTCTCTCTCTCGGACTCTCGTTCAGCAATCGTCACAGCCGCTGCCGCGCACACCATCCTCTCCCTAGCCTCTCGCCCTCTGTTTTCCTTCATTTATCTCCTTCCCTCCTTCACGAATTCCGGCGAGATCCGCCATTTAACGTGGTGCTCTGCTGCACTTCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005206
ATGGATGGGAAGGACATCCAATCAGATCTTCATGCCCTTAAAAGACTCTATGGGCTTCTCAAAAACGATGGAGACGAAGCTTCGGACTCCGGCTCTGATTCGCTAGATGCGCACGCTCGGATTTTCTTAAAGAATCTTTTGGATGTGGAGACTAAAAGAGTACTCAAGACACATTCAGAAGTCATTGCAGGTCAAGCCGAAACATCGGGGGCACTTTCTCCTGCTCGGCTTCAGCAACTAGATGAGGTAGCCTCCGAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788025.1
MDGKDIQSDLHALKRLYGLLKNDGDEASDSGSDSLDAHARIFLKNLLDVETKRVLKTHSEVIAGQAETSGALSPARLQQLDEVASEERPTTRSRLSIAVEGDQSSDGRLTPEWSQAGGAMEQSIHRVPSIGQKRCRVCQRNTVKQLGSRGETHFHQVVRNSNTYADHQYRQNSVRNREKEIGWLSSNMSDDSKCEKRRQRPSDLNVIGGADISSDRMATDISEICHSNMETIGKPGEPDCLSQEASKAIQQIELCMSALR...

XP_057788026.1
MDGKDIQSDLHALKRLYGLLKNDGDEASDSGSDSLDAHARIFLKNLLDVETKRVLKTHSEVIAGQAETSGALSPARLQQLDEVASEERPTTRSRLSIAVEGDQSSDGRLTPEWSQAGGAMEQSIHRVPSIGQKRCRVCQRNTVKQLGSRGETHFHQVVRNSNTYADHQYRQNSVRNREKEIGWLSSNMSDDSKCEKRRQRPSDLNVIGGADISSDRMATDISEICHSNMETIGKPGEPDCLSQEASKAIQQIELCMSALR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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