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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001324`

染色体: Chr01 坐标: 26303068-26311748 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001324`
名称	SmilChr01G001324
描述	L-ascorbate oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26303068 - 26311748 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005226`
GeneID	`131005226`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005226`
原始查询	`LOC131005226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase-like
产物	L-ascorbate oxidase-like
Arabidopsis	`AT5G21105` (AT5G21105) Plant L-ascorbate oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832235] identity=43.7; qcov=0.877; evalue=6.39e-44; confidence=medium
Rice	`Os06g0567200` (OsAAO1) - identity=60.4; qcov=0.612; evalue=1.86e-48; confidence=medium
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005226

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788053.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788053.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788053.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788053.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788053.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26303648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A10,B103,B107,B128,B134,B37,B53,B63,B73,B76,B87,B98,C39,C67,D3
`Chr1:26303665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B121,B22,B40
`Chr1:26303668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B121
`Chr1:26303790`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr1:26303790`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr1:26303802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B131,C13,C29,D10
`Chr1:26303918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:26303923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:26303926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B33,C61
`Chr1:26303955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C25,C30
`Chr1:26304192`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	135	A1,A10,A13,A18,A19,A2,A21,A24,A3,A5,A8,B10,B104,B105,B109,B11,B111,B112,B12,B122,B124,B125,B13,B130,B134,B136,B140,B15,B17,B19,B20,B23,B25,B30,B32,B33,B34,B35,B4,B41,B45,B46,B47,B48,B5,B51,B53,B54,B55,B56,B58,B61,B62,B64,B65,B68,B7,B71,B72,B74,B75,B76,B79,B8,B81,B83,B87,B88,B89,B9,B91,B93,B95,B96,B97,C10,C15,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C25,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C68,C7,C72,C74,C75,C78,C79,C8,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:26304242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788053.1

227 aa

114

227

Cu-oxidase_3

PF07732 Cu-oxidase_3 15-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788053.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	15	119	1.2e-33	116.4	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932070.1
ATCACAAATTAAATTGAACTCAACGATCGACAAGCAAAATATATATCAGAAATTAAGCAAATTAAGCGGAGCAATGGCACGAGGGATGATGATGAGCGTGGCAGTGTTGGTGGTGGCGCTGGCGGTGCAAGGCGCGGCAGCGGAGGGAGTGGAGGCGGCCGACAAGATGGGGAAGTGCCTTGTGACGAGAAAGTGGTGTTCTGCGCGGCCAAGTGTAGAATTGGTGGCGGCAAGGCTGCATGCTATGAGGACTGTGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005226
ATGAGTAATAGTGTAAGGGCAGAGCAGAATTTGAGATGGGAGGTGGGATACATGCGGTGGTCTCCAGACGGGGTGGAAGATGTGATTATGACCATCAACGGCCACTACCCGGGCCCCACCATTCGGGCTGTGGCCGGCGAGACCATTCAGGTTCACCTCACCAACGGCCTTCCCACAGAGGGAGTCGTCATCCACTGGCATGGAATCAGACAGATTGGGACACCATGGTCGGATGGAACAGCCTCCATCTCGCAGTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788053.1
MSNSVRAEQNLRWEVGYMRWSPDGVEDVIMTINGHYPGPTIRAVAGETIQVHLTNGLPTEGVVIHWHGIRQIGTPWSDGTASISQCAINPGESFVYKFTVDRAGTYFYHGAFRDATVSGALRDVDRERAPRRGDAPVRCRVARRDGTRDDEYGGVGGGGRGGGAARPRGGTVCLMGCGEKLVICAAECEFKGGKTECYEDCGSGDAKCVESCIASENTRFNIIASPP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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