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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004896`

染色体: Chr01 坐标: 67034767-67037714 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004896`
名称	SmilChr01G004896
描述	uncharacterized SmilChr01G004896
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67034767 - 67037714 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005236`
GeneID	`131005236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005236`
原始查询	`LOC131005236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0257900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0257900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G16060` (AT5G16060) Cytochrome c oxidase biosis protein Cmc1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831463] identity=77.4; qcov=1; evalue=6.17e-49; confidence=medium
Rice	`Os03g0257900` - identity=81.8; qcov=0.946; evalue=3.59e-49; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF08583 (Cmc1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057788064.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	1.00000	`XP_057788064.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057788064.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788064.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67036235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B24,C61,C8
`Chr1:67036285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67036302`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr1:67036302`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:67036312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A2,A24,A8,B113,B115,B20,B23,B33,B40,B47,C16,C62,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788064.1

93 aa

Cmc1

PF08583 Cmc1 21-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788064.1`	Pfam	`PF08583`	Cmc1	Family	21	83	3.6e-17	62.9	Cytochrome c oxidase biogenesis protein Cmc1 like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932081.1
CAATTTATCTATAAACGTCAACTACAGAAGCAAAAATCGGCGAATTAGTTAATTAGGGGCGAATTTATTTAACGCTTTTAGTTGAAGGGACAAGAATTGCAGAAATACCTCACAAGCATTATTGTTTAGCAGATGTAACTGGAACACACCGTCACACTCCATTTCTGCTAAGGAGTTCAATTTGTGACTCTGAATCAGTTAAAATGGGCTACGTACAAGAAGCCAGAGAAAATCACGTCAAGAAGAAGGTCGAAGAAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005236
ATGGGCTACGTACAAGAAGCCAGAGAAAATCACGTCAAGAAGAAGGTCGAAGAAGCTTTGCGCAGTAAGATGAAACAGAAAGCACTGAAAGAATGCGATCAATACGTGTCCAAATATGCTGAATGTGCTGTAGGCAGAACATTGTCCGTTGTTTGGAAATGTCGCGGTGAAGCTAAGGAATTGAATACATGCCTCCATCAGTACACAAATGATTCTGTCTTGGAAAAAATGAAGAAAGAATACATGCTTCAACAGGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788064.1
MGYVQEARENHVKKKVEEALRSKMKQKALKECDQYVSKYAECAVGRTLSVVWKCRGEAKELNTCLHQYTNDSVLEKMKKEYMLQQEGKGSLSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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