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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004903`

染色体: Chr01 坐标: 67092391-67094412 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004903`
名称	SmilChr01G004903
描述	protein SHORT HYPOCOTYL IN WHITE LIGHT 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67092391 - 67094412 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005242`
GeneID	`131005242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005242`
原始查询	`LOC131005242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SHORT HYPOCOTYL IN WHITE LIGHT 1-like
产物	protein SHORT HYPOCOTYL IN WHITE LIGHT 1-like
Arabidopsis	`AT4G33780` (AT4G33780) ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829520] identity=65.7; qcov=0.518; evalue=2.41e-44; confidence=medium
Rice	`Os02g0531900` - identity=53.1; qcov=0.249; evalue=6.97e-06; confidence=weak
GO	GO:0009787 (regulation of abscisic acid-activated signaling pathway); GO:0010100 (negative regulation of photomorphogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF28670 (SHW1_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788096.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057788096.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057788096.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788096.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67094126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B140
`Chr1:67094183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:67094188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788096.1

197 aa

197

SHW1_helical

PF28670 SHW1_helical 84-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788096.1`	Pfam	`PF28670`	SHW1_helical	Domain	84	193	6e-50	168.8	SHORT HYPOCOTYL IN WHITE LIGHT 1 helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932113.1
ATAAACTAAAATAAAATAAAACGAAAAGAAGTGAGTATTTCTTGAAAAGAAAAAAGAGTTAATAGAGAGAAAATCTGCAACCAAGCATTATGCACCCAAAATTTTCCGAAATCTCAAAATAGTCCTTTAAAAACTTGCCAAATTCATCCCCGTCGTCTCTCTGCTGTGAATCAGCACAACTCCAGAGAAGCTGAGCTCCTGTCGCCACTGTTATGGCGGGGAACGCCGTCACTCTCCGTCTTCAGCATCTCTATTCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005242
ATGGCGGGGAACGCCGTCACTCTCCGTCTTCAGCATCTCTATTCTTCTCCTCGAACGTCATTACCTCACTATTCCTTGGTCAATTCTCATAACCCCATCCTCCAGTTCGGTTGCAATCGCACGAACAATTCTCTTCTCCCTCACGAGAAATGCCGGAATCCAGTCCACGAAGTTCGGGCTTGGAGCGCGAGACCGCGAAGTGGTATGGTGATGGGCGACTACATCGATGATATCGACGAAGATGATGATGAGGATGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788096.1
MAGNAVTLRLQHLYSSPRTSLPHYSLVNSHNPILQFGCNRTNNSLLPHEKCRNPVHEVRAWSARPRSGMVMGDYIDDIDEDDDEDDEEEEEEDRSLDLLIRFVENVFRKVSRKARRAVKSVLPVPISTKLVGFAVNGTIILTFMWVLKAFLQVICTLGSVVFVSILIIRGIWSGISYLQESRAYEDEPRSHSWKPAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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