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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004905`

染色体: Chr01 坐标: 67106353-67109520 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004905`
名称	SmilChr01G004905
描述	probable zinc metallopeptidase EGY3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67106353 - 67109520 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005244`
GeneID	`131005244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005244`
原始查询	`LOC131005244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable zinc metallopeptidase EGY3, chloroplastic
产物	probable zinc metallopeptidase EGY3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G17870` (EGY3) ethylene-dependent gravitropism-deficient and yellow-green-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838366] identity=74.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0729000` (EGY3) - identity=69.3; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27677 (EGY3_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788098.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057788098.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057788098.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057788098.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67106841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C75
`Chr1:67106901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C79
`Chr1:67107142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:67108517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:67108572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B128,B61
`Chr1:67108967`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr1:67108967`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr1:67108970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:67109087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:67109284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788098.1

576 aa

288

576

EGY3_M

PF27677 EGY3_M 186-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788098.1`	Pfam	`PF27677`	EGY3_M	Domain	186	261	2.1e-26	92.4	EGY3 middle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932115.1
AAGACAGATTCAGTTATCCAATAATAACCCACTCTCCATTATCTGGAAATCTAACTCCGCTCTTTCAAAAAATCCATCAACAATTCCTCAACACAACTTAAATTCCTACATTTTCCTTTTCCTGTTAAAAAAGTTTGTGTTGCTAAAAAGCGTCAATGTCACTTGCTTCAATCTTCTATTCCCTCCAGAAACTCCTCCAGTTTTCTGGAAAAATCATGCTCCTCTCTAAAAAGCCCGCTCTCTCCCATTCTTCAATCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005244
ATGGCAACTGCTCTCTTTGCTTCATTTCCGTGCTCCTCTTCCTCGCGGATTGTCGAGAAAAGCTCGTTTCACATCTCATCCTTTTCTTCTCACTCTTCCTTTTCCACACGCCCTTTTGGGAAGAGCACCAGATTTTCGCGCCAAAGATTGAATCTTTGTGTGAAAGCTGAGAATTCGGATAAGCCCTCTTCTTCGTCTTCGTCCGTGGCGGTGGAGGAGCCCAAAGATGAAGTGAACGAAGAGAAAGATTTGCGCGTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788098.1
MATALFASFPCSSSSRIVEKSSFHISSFSSHSSFSTRPFGKSTRFSRQRLNLCVKAENSDKPSSSSSSVAVEEPKDEVNEEKDLRVGNDSTSSDSEHEDETKEKEARQEMDWKVDEEFKNFMGNPSIEAAIKLEKKRADRKLKQLDRERSDNPLIGFFNNLVRENVSREKERLEKAEETFKALDLNKLKSCFGFDTFFATDVRRFGDGGIFVGNLRKPIEEVIPKLEKKLSEAAGRDVVVWFMEEKTNDITKQACVVQPM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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