Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001331`

染色体: Chr01 坐标: 26501939-26502886 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001331`
名称	SmilChr01G001331
描述	uncharacterized SmilChr01G001331
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26501939 - 26502886 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005254`
GeneID	`131005254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005254`
原始查询	`LOC131005254`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788115.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788115.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788115.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057788115.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26501944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:26501947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C59,C6
`Chr1:26501961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B82
`Chr1:26501992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:26502029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:26502060`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A14,B127,B20,B8,B82,C14,C31,C65,C9
`Chr1:26502063`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B48,B90,C59,C6
`Chr1:26502063`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B48,B90,C59,C6
`Chr1:26502064`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B48,B90,C59,C6
`Chr1:26502064`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B48,B90,C59,C6
`Chr1:26502160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B7,B83,C59,C77
`Chr1:26502193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932132.1
ATGAAGAAGAAATCCAAAACCAGCAGCGAACTCATTCCCAACACCAAGGAGATCAACGGCGATGAAGAGGAGGAGAAGGATGAGAATGATGAGAAGAAGGAGAATGAGAATGAGAATGAGAAGGAGAATGAGAAGGAGACGGAGAAGGAGATGGAGATCAAAACGGAGACAGAGATCGAGATGGACATGGGCATGGAGATGCATGTGGAGATGGAGATGGAGATGGAGAAAGAGAAGGAGCAAGTGATGGAGAAGGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005254
ATGAAGAAGAAATCCAAAACCAGCAGCGAACTCATTCCCAACACCAAGGAGATCAACGGCGATGAAGAGGAGGAGAAGGATGAGAATGATGAGAAGAAGGAGAATGAGAATGAGAATGAGAAGGAGAATGAGAAGGAGACGGAGAAGGAGATGGAGATCAAAACGGAGACAGAGATCGAGATGGACATGGGCATGGAGATGCATGTGGAGATGGAGATGGAGATGGAGAAAGAGAAGGAGCAAGTGATGGAGAAGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788115.1
MKKKSKTSSELIPNTKEINGDEEEEKDENDEKKENENENEKENEKETEKEMEIKTETEIEMDMGMEMHVEMEMEMEKEKEQVMEKEEEEEKNSGRKEKKEKNKEKKEKKLRQKEKDLEPKESNDEDEKEKEKNNDHKDKKEKFFSRLRKEKKLRPKEKDAESKESNDDEEKEKDKDKDKDKDKEKEKSSDHKDKKETFFSKIKKEKKLRQKVEDSEAKESNDDEEMEKEKEKEKSSDHKEKKENFFSRIKKEKKHRQKEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器