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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004916`

染色体: Chr01 坐标: 67193509-67195116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004916`
名称	SmilChr01G004916
描述	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67193509 - 67195116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005257`
GeneID	`131005257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005257`
原始查询	`LOC131005257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
产物	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
Arabidopsis	`AT4G33800` (AT4G33800) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829522] identity=34.7; qcov=0.957; evalue=1.89e-19; confidence=low
Rice	`Os03g0199500` - identity=32.2; qcov=0.658; evalue=2.59e-06; confidence=low
GO	GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF30936 (SOFL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788116.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788116.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788117.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788116.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788116.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67193912`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	76	A10,A18,A25,A7,B101,B104,B109,B111,B115,B117,B121,B137,B138,B14,B17,B2,B22,B24,B25,B29,B34,B36,B39,B41,B47,B5,B50,B54,B59,B63,B67,B68,B73,B76,B78,B82,B85,B87,B88,B91,B93,B94,B95,B96,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C19,C24,C27,C28,C29,C30,C33,C34,C36,C38,C40,C41,C43,C45,C48,C54,C6,C73,C74,C80,C81,D3,D5,D7,D8
`Chr1:67194335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788116.1

211 aa

106

211

SOFL

PF30936 SOFL 4-123 aa

XP_057788117.1

185 aa

185

SOFL

PF30936 SOFL 4-132 aa

XP_057788118.1

184 aa

184

SOFL

PF30936 SOFL 4-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788116.1`	Pfam	`PF30936`	SOFL	Family	4	123	5.1e-12	47.1	SOB FIVE-LIKE
`XP_057788117.1`	Pfam	`PF30936`	SOFL	Family	4	132	3.3e-12	47.8	SOB FIVE-LIKE
`XP_057788118.1`	Pfam	`PF30936`	SOFL	Family	4	132	3.2e-12	47.8	SOB FIVE-LIKE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932135.1
GACAATACAAAACGGGGCTATTTAATTTGCATTTGTGTAGTTGGTAGAAATTAATATATATACATCTTAAAAAGTGATTAGTAGATATGTTGGAGTTAATCTCAAGGTAGGGAAGGGATCACTCACATGTAGACACATCGAACATATCCAATGCCCATTTGCATGCAATTTACACATAACCCCCTCGTGCCCAACTGGCACAAAATTGATTCATTCTTGGAGAGAGTTTGAATAGTGACAAAAAAAAAAACTCTCAATTA...

XM_057932134.1
GACAATACAAAACGGGGCTATTTAATTTGCATTTGTGTAGTTGGTAGAAATTAATATATATACATCTTAAAAAGTGATTAGTAGATATGTTGGAGTTAATCTCAAGGTAGGGAAGGGATCACTCACATGTAGACACATCGAACATATCCAATGCCCATTTGCATGCAATTTACACATAACCCCCTCGTGCCCAACTGGCACAAAATTGATTCATTCTTGGAGAGAGTTTGAATAGTGACAAAAAAAAAAACTCTCAATTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131005257
ATGAATTACATGTTCGGAAATGCAGAATGCAGCAGCGGTTGCGAGTCAGGTTGGACTCTCTACTTGCAACACTCTTCAATATCTGCAGATGCAGCTTGTTACGAGGAGACACGGACGAAGAGATCGGAAGATGAAGAAGACGAAGATCTGTCGATGGTGTCGGACGCCTCGTCCGGCCCACCGCAGCTGCATGAGGAAGAAGTTGACAAAAGCGGCTGCAGCTTCTATCACTATAGTACTACCACCGTTACCCAACCCTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057788116.1
MNYMFGNAECSSGCESGWTLYLQHSSISADAACYEETRTKRSEDEEDEDLSMVSDASSGPPQLHEEEVDKSGCSFYHYSTTTVTQPLSKNIHLARKKNRDNRCRKLKVQEHSSLLDDTASSPLLYDFCNKTRSQASVENVVEYSQGYSSTQFEVRPPYQEEHYDFLQSGNQLQQQNQLSFYYALLSFFFLFFFLGSIFFFISFRFCYVFST

XP_057788117.1
MNYMFGNAECSSGCESGWTLYLQHSSISADAACYEETRTKRSEDEEDEDLSMVSDASSGPPQLHEEEVDKSGCSFYHYSTTTVTQPLSKNIHLARKKNRDNRCRKLKVQEHSSLLDDTASSPLLYDFCNKTRSQASVENVVEYSQGYSSTQFEVRPPYQEEHYDFLQSGNQLQQQNHRWFEGKRW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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