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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004927`

染色体: Chr01 坐标: 67339611-67342046 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004927`
名称	SmilChr01G004927
描述	uncharacterized SmilChr01G004927
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67339611 - 67342046 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005265`
GeneID	`131005265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005265`
原始查询	`LOC131005265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0588300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0588300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G14170` (AT3G14170) - identity=30.4; qcov=0.591; evalue=1.08e-34; confidence=low
Rice	`Os07g0588300` - identity=29.9; qcov=1.08; evalue=4.39e-52; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06075 (CORD_N); PF21647 (CORD_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788134.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057788134.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788134.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788134.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788134.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67340117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B93,C82
`Chr1:67340295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:67340319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B111,B57,D4
`Chr1:67340406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B52,B8
`Chr1:67340409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:67340425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:67340440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B44,B50,C19
`Chr1:67340481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:67340580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C53
`Chr1:67340601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:67341249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr1:67341335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B111,B57,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788134.1

540 aa

270

540

CORD_N

CORD_C

PF06075 CORD_N 4-123 aa PF21647 CORD_C 257-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788134.1`	Pfam	`PF06075`	CORD_N	Domain	4	123	7.6e-43	145.9	CORD, N-terminal domain
`XP_057788134.1`	Pfam	`PF21647`	CORD_C	Domain	257	535	1.6e-63	216.0	CORD, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932151.1
AAAGGAGCACTAAATTTAAATATGCCAATGCATGTTTTACTTCAATCCAACTCGATTGTTTTTTAATGTTTATTTTCCCCACCAACACAGATTTATTTTTTTTAAAAAAAATGTTTAGTTAAAAAATTAATTAAGAAATTACACCAGACCTCAATTCTGAACTGGACATTCGGATTTGTCCCATCTCTAATTATTTGCTGCGTATATCTTCACGAGAAACCAATTTTATATCTGGTTGTCTTCTTATTATGCGATAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005265
ATGGTTAGTTTAAAAGAGGGGGTTCTGTTGAAGCTGGTGGAAGAGATGAAAAGGAACAAGGGCGATCCAATGGAGAGCTGTGCAATCTCAAAGCCTGTGTTGTTGCAAATCAGGAGCATCATCCCCGTCCTCGAAGAAGGCGATCTCTGGCCCAGCCGCGGCTTCTTCCTCAAAGTCTCCGATGCCTCCCATGCATTGTACGTCTCCCTCTCCAAGCAGCAGAATGACATGATCCTCGCCAACAACCTCCAGCTCGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788134.1
MVSLKEGVLLKLVEEMKRNKGDPMESCAISKPVLLQIRSIIPVLEEGDLWPSRGFFLKVSDASHALYVSLSKQQNDMILANNLQLGQFIYVNKLDPADPLPLLRGLAPIPGRRPCEGTPQDIASPPPPVLGRRGRASESSRRKSDGGVRAARSRSSSPVKAKNGGDSDATMPKRVPKRRSWSESEILGVKEIFDSSVVKHEMKLPSRKSASASASPARYDSSDDSSSCVSRSRAGGGGGLGKRGNASLHSLCNVICDRKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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