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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004926`

染色体: Chr01 坐标: 67332558-67335580 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004926`
名称	SmilChr01G004926
描述	uncharacterized SmilChr01G004926
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67332558 - 67335580 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005267`
GeneID	`131005267`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005267`
原始查询	`LOC131005267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0202300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0202300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19630` (AT3G19630) Radical SAM superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821500] identity=73; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0202300` - identity=71.7; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008173 (RNA methyltransferase activity); GO:0030488 (tRNA methylation); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	-
Pfam	PF04055 (Radical_SAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057788135.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057788135.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788135.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788135.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67333107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:67333173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B5,B61,C18,C84
`Chr1:67333642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:67334288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr1:67334362`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A20,B106,B121,B34,B61,B86,C11,C29,C51,C65,C69
`Chr1:67334481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67334487`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	114	A18,A19,A2,A21,A22,A23,A3,A5,A6,A7,B103,B107,B109,B110,B112,B115,B120,B123,B125,B126,B128,B13,B131,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B18,B2,B20,B21,B22,B24,B26,B28,B3,B31,B33,B34,B36,B38,B41,B42,B43,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B58,B61,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B75,B76,B8,B82,B84,B86,B87,B90,B92,B96,B97,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C22,C29,C30,C31,C37,C4,C40,C43,C44,C46,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C57,C58,C60,C65,C71,C77,C83,C86,C87,D1,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr1:67335205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:67335325`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr1:67335325`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr1:67335351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B124
`Chr1:67335351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788135.1

372 aa

186

372

Radical_SAM

PF04055 Radical_SAM 120-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788135.1`	Pfam	`PF04055`	Radical_SAM	Domain	120	278	2.2e-11	44.9	Radical SAM superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932152.1
GATGAGTGTGTTTGTAAGTAGATTTCATTCAAAGTTGATATTTTTCCTCTCTTAACCCTAGAAAAAAATAAAGTTGAATGACAGTAGGGGTTGCAAATAACAATGGACAAAGTTCAATACCCTTCAAACTTTTAACCAACTCTCGCCGATGGCGTACAAATCGGTGTTCGACGTTTCCGCCATTAAATCCGATTTCGAGGTAGCCGGTTTAAACCCTAATTTCATTCCCCAAATCTGGAAACACGTCTTGAAAAATCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005267
ATGGCGTACAAATCGGTGTTCGACGTTTCCGCCATTAAATCCGATTTCGAGGTAGCCGGTTTAAACCCTAATTTCATTCCCCAAATCTGGAAACACGTCTTGAAAAATCCTAATTGCCGATGGGATGAAATCCCTTCTCTGCCCTCCGCGGCTTACCATCTCCTCGATTCCAAGTTCAGACCCTCCACTTCCACTCTCCATTCCGCCATAGATTCTTCCGACCAGGTCACCACTAAGCTCCTCATCAAATTGCAGAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788135.1
MAYKSVFDVSAIKSDFEVAGLNPNFIPQIWKHVLKNPNCRWDEIPSLPSAAYHLLDSKFRPSTSTLHSAIDSSDQVTTKLLIKLQNGEFVEAVIMRYDTRLGKYDGKPRLGGPRSTLCVSSQVGCKMGCNFCATGSMGFKKNLSSGEILEQLVHASRISAIRNVVFMGMGEPLNNYTAVVDAIRAMTALPFQLSPKKITLSTVGIIHAINKLQRDIPNLNLAVSLHAPVQEIRCQIMPAARAFPLERLMNALREYQTSSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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