当前解析结果
SmilChr01G004941| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004941 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004941 |
| 描述 | 40S ribosomal protein S29-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 67534638 - 67536477 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005279 |
|---|---|
| GeneID | 131005279 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005279 |
| 原始查询 | LOC131005279 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 40S ribosomal protein S29-like |
| 产物 | 40S ribosomal protein S29-like |
| Arabidopsis | AT3G44010 (AT3G44010)Ribosomal protein S14p/S29e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823518] identity=89.3; qcov=1; evalue=3.02e-33; confidence=medium |
| Rice | Os12g0508300- identity=92.9; qcov=1; evalue=4.73e-36; confidence=medium |
| GO | GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit) |
| KEGG | smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00253 (Ribosomal_S14) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005279 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057788159.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057788159.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788159.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788159.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788159.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057788159.1PF00253
Ribosomal_S14 7-55 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057788159.1 |
Pfam | PF00253 |
Ribosomal_S14 | Family | 7 | 55 | 9.6e-16 | 58.0 | Ribosomal protein S14p/S29e |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。