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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001340`

染色体: Chr01 坐标: 26632222-26632977 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001340`
名称	SmilChr01G001340
描述	uncharacterized SmilChr01G001340
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26632222 - 26632977 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005290`
GeneID	`131005290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005290`
原始查询	`LOC131005290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.2; qcov=0.57; evalue=1.54e-35; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=57; qcov=0.944; evalue=1.89e-93; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788172.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788172.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788172.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788172.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26632260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B83,C77
`Chr1:26632261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:26632300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:26632329`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C55,C69
`Chr1:26632329`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C55,C69
`Chr1:26632334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C83
`Chr1:26632336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B10,B4,C75,C83
`Chr1:26632349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B50,B54
`Chr1:26632354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A10,A7,B103,B106,B110,B126,B23,B33,B50,B55,B6,B69,B74,B76,B79,B86,B91,B99,C19,C21,C24,C32,C40,C7,C73,C8,C82,D6,D9
`Chr1:26632363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:26632371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A8
`Chr1:26632371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788172.1

251 aa

126

251

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788172.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	4.2e-19	68.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057788172.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	248	1.4e-48	165.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932189.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCTGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCACCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005290
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCTGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCACCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788172.1
MTVASSYRFDPPPPRPRKKRAVVRRDREGGAERLHRDYFTVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAVGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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