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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004954`

染色体: Chr01 坐标: 67621710-67623566 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004954`
名称	SmilChr01G004954
描述	classical arabinogalactan protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67621710 - 67623566 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005293`
GeneID	`131005293`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005293`
原始查询	`LOC131005293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	classical arabinogalactan protein 9-like
产物	classical arabinogalactan protein 9-like
Arabidopsis	`AT4G37450` (AGP18) arabinogalactan protein 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829900] identity=50; qcov=0.282; evalue=1.19e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF30998 (Lys-rich_AGP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005293

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788171.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788171.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788171.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788171.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67622203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:67622248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67622326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B53,C8
`Chr1:67622419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A9,B127,B30,B79
`Chr1:67622533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C24,C29
`Chr1:67622569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:67622602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:67623283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B34,B38,B39,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788171.1

213 aa

106

213

Lys-rich_AGP

PF30998 Lys-rich_AGP 5-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788171.1`	Pfam	`PF30998`	Lys-rich_AGP	Family	5	212	1e-13	52.7	Lysine-rich arabinogalactan protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932188.1
GTGCAGCAGAAACCCTACTTCATCTACATTCACTACAATGCAGAGAAGATGTAATAGTAGGACCCGTATGTATCTCACTGCAGACGATCGATTTTGTCCAAATAGTATGTTGCACGAACTTGACGTCCAGACAAAATAAAGTGGGCCACCCTTCTCTTTACTCCACTACGGTTCCACGCCTTACAAATACACCTTTTTCCGCTTAAAAACGCATTTACACTCGCTGCTTTAAATCGTACCCTTCCTATATATACATACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005293
ATGGCTCCCAACCTGCTAGTCTTCACTGCCGTGATCTGCATTGCCGTCGCCGTCGTCAGCGGCCAATCTCCGGCTACTTCTCCGACCGCCACTCCTGCTCCGCCTACTCCTACCACTCCTGCTCCGCCCACTCCCACTCCTCCCACCGCGTCTCCGCCTCCCGTGACCACACCGACGCCGCCAGCAGCAACGCCGCCGCCTGTCTCCGCGCCACCCCCGGTGGTTACTTCTCCGCCTCCTGCAGCAACGCCGCCTCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788171.1
MAPNLLVFTAVICIAVAVVSGQSPATSPTATPAPPTPTTPAPPTPTPPTASPPPVTTPTPPAATPPPVSAPPPVVTSPPPAATPPPVSTPPPVAAPPPVSTPPPATPPPAVPPPASPPPPVLSPPPPVAPTPAPLASPPAAVPVPAPSKPTSPAPSPSLSSPPAPPTGAPGPSLPGLSPAPSATDQSGANSVRAAQMISSSAVLGWALMILVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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