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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004958`

染色体: Chr01 坐标: 67678570-67681247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004958`
名称	SmilChr01G004958
描述	thioredoxin domain-containing protein 9 homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67678570 - 67681247 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005297`
GeneID	`131005297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005297`
原始查询	`LOC131005297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin domain-containing protein 9 homolog
产物	thioredoxin domain-containing protein 9 homolog
Arabidopsis	`AT2G18990` (TXND9) thioredoxin-like/ATP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816416] identity=73.6; qcov=0.981; evalue=7.66e-114; confidence=high
Rice	`Os08g0250700` - identity=71.2; qcov=1; evalue=1.61e-111; confidence=high
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788180.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057788180.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788180.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788180.1`
5	Midbody	Midbody	0.40000	`XP_057788180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67679219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:67680695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67680925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788180.1

212 aa

106

212

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 73-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788180.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	73	155	6.2e-08	33.3	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932197.1
TTAAATCAAGTTGTTGATAAGTTTCATTTGAATTTCTCTAAACAATTAGGTGGTGTTTTCCCCCGCTGCCTAAATAATTTTATCTTTCAATCGTGATTTCTTTGTTTTTTTTATGCTTAAAGCAAAAAAATGTGCTCCAAATATAGGTGGACTGTGGGCTATTATTGAATAGGTAATCGTTTTTAAGCCCAGGAAGTCGTACCGGGCTAAAACCATTCCTAACATTATCAATAAAATCTGCCCAATTTCTGCATTTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005297
ATGGATAACTCAGTAGTTCGAGAGATATTGGAGCAGCAAGTCCTGTCGGTGGCGAAAGCGGTGGAGGAAAAGATAGATGACCAGATCTCGGCATTGGATCGGATGGATCCTGACGATATCGAGGCGTTGAGGGAGCGGAGGCTGCAGCAGATGAAGAAAATGGCGGAGAAGAGGAGCCGTTGGATCAGCCTCGGCCATGGCGAGTACTCTGAGATCCACAACGAGAAGGAGTTTTTCTCTATTGTCAAAGCTAGTGAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788180.1
MDNSVVREILEQQVLSVAKAVEEKIDDQISALDRMDPDDIEALRERRLQQMKKMAEKRSRWISLGHGEYSEIHNEKEFFSIVKASERVVCHFYRENWPCKVVDKHLAILAKQHIETRFVKLNAEKSPFLSEKLRIVVLPTLALVKNAKVEDYVVGFDELGGRDDFSTEELEERIAKAEVINFEGESSGKLSKSKAPTRNVRHGSSSYSSDSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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