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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004966`

染色体: Chr01 坐标: 67769425-67778147 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004966`
名称	SmilChr01G004966
描述	pathogenesis-related homeodomain protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67769425 - 67778147 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005305`
GeneID	`131005305`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005305`
原始查询	`LOC131005305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related homeodomain protein
产物	pathogenesis-related homeodomain protein
Arabidopsis	`AT3G19510` (HAT3.1) Homeodomain-like protein with RING/FYVE/PHD-type zinc finger domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821485] identity=41.5; qcov=0.753; evalue=4.2e-117; confidence=medium
Rice	`Os06g0229300` (HAZ1) - identity=40.5; qcov=0.815; evalue=1.92e-129; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006325 (chromatin organization); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF00628 (PHD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005305

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788187.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788187.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788187.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788187.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67770307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:67770728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:67771107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C42
`Chr1:67771701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B66,C8
`Chr1:67773116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:67775658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C76,C77
`Chr1:67777417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788187.1

815 aa

408

815

PHD

Homeodomain

PF00628 PHD 349-400 aa PF00046 Homeodomain 704-748 aa

XP_057788188.1

815 aa

408

815

PHD

Homeodomain

PF00628 PHD 349-400 aa PF00046 Homeodomain 704-748 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788187.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	349	400	6.3e-10	39.6	PHD-finger
`XP_057788187.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	704	748	1e-08	35.6	Homeodomain
`XP_057788188.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	349	400	6.3e-10	39.6	PHD-finger
`XP_057788188.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	704	748	1e-08	35.6	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932204.1
GTGGAATCATCCGTCCGTCAGAATTGCCTGCGCTCCATGAGCGCATGTTAGCGTTGGGCATAAGTCAAATTAGCCCTTCTCTCTCTCTCGGTTGTGTCAGCGAGGGAACCTCCTACTTGCTAGTGCATATTTGGAGGATTAAAGCGCGCACACAAAAACACACACACCAAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGGGAGAGAGGCGGTTTCACATTTTGTGTGCGGTGAGAAGCGTCTTCGTCTGCGGGTGATGT...

XM_057932205.1
GAGCGCATGTTAGCGTTGGGCATAAGTCAAATTAGCCCTTCTCTCTCTCTCGGTTGTGTCAGCGAGGGAACCTCCTACTTGCTAGTGCATATTTGGAGGATTAAAGCGCGCACACAAAAACACACACACCAAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGGGAGAGAGGCGGTTTCACATTTTGTGTGCGGTGAGAAGCGTCTTCGTGAACTAGGGAAGTGAGAAGTTGCATGGGAAGTTTTTAGTGTGTTCATTAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005305
ATGGGGCTGATAGAGAATGGGGCAGCACAACCTGAGTCTAACATGGTAGAACAGCCGAGAACTCCTAAAGATCCAGCTCGAGATAAAAAATATGATCCACCATATGACTGTCGAATGGATCACAAAAGGTGTGTTGGTGAAACAATGGAGCAAAAAGAGATGAGTGAAGCTCAATATATTGAAAGGACATCAGTTTCAGCACAGGAAGAATCACATGATATTCGAGAAATAGGACTGAATACAAATAATAGAGAGACTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788187.1
MGLIENGAAQPESNMVEQPRTPKDPARDKKYDPPYDCRMDHKRCVGETMEQKEMSEAQYIERTSVSAQEESHDIREIGLNTNNRETPHNEDTNKQEPTLENVSIFSDSKYLEFASQNGLGCLEDMVIPPGTTSVNPGCGTLVPLNVEATNDSVLLENGDRGSSGESPGCGKLIPLKVEATNDSVLLENDGIGSSRQRVRRNAKLEGPSSSSWLLRSRSQEKTKAPEPVENVNEGSAIGEKKKRGRKPKNMQKTTVSEFSS...

XP_057788188.1
MGLIENGAAQPESNMVEQPRTPKDPARDKKYDPPYDCRMDHKRCVGETMEQKEMSEAQYIERTSVSAQEESHDIREIGLNTNNRETPHNEDTNKQEPTLENVSIFSDSKYLEFASQNGLGCLEDMVIPPGTTSVNPGCGTLVPLNVEATNDSVLLENGDRGSSGESPGCGKLIPLKVEATNDSVLLENDGIGSSRQRVRRNAKLEGPSSSSWLLRSRSQEKTKAPEPVENVNEGSAIGEKKKRGRKPKNMQKTTVSEFSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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