当前解析结果
SmilChr01G004973| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004973 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004973 |
| 描述 | LYR motif-containing protein At3g19508 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 67819567 - 67820587 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005312 |
|---|---|
| GeneID | 131005312 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005312 |
| 原始查询 | LOC131005312 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | LYR motif-containing protein At3g19508 |
| 产物 | LYR motif-containing protein At3g19508 |
| Arabidopsis | AT3G19508 (AT3G19508)complex 1 protein, LYR family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008013] identity=71.2; qcov=0.92; evalue=4.43e-37; confidence=medium |
| Rice | Os01g0342800- identity=65.8; qcov=0.908; evalue=1.42e-31; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05347 (Complex1_LYR) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005312 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057788197.1 |
| 2 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 0.40000 | XP_057788197.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057788197.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788197.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788197.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057788197.1PF05347
Complex1_LYR 7-61 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057788197.1 |
Pfam | PF05347 |
Complex1_LYR | Family | 7 | 61 | 3.9e-06 | 27.4 | Complex 1 protein (LYR family) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。