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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005002`

染色体: Chr01 坐标: 68066131-68067951 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005002`
名称	SmilChr01G005002
描述	allene oxide synthase 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68066131 - 68067951 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005339`
GeneID	`131005339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005339`
原始查询	`LOC131005339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	allene oxide synthase 3-like
产物	allene oxide synthase 3-like
Arabidopsis	`AT5G42650` (AOS) allene oxide synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834273] identity=50.4; qcov=0.994; evalue=3.88e-166; confidence=high
Rice	`Os03g0225900` (AOS2) - identity=55.8; qcov=1; evalue=1.56e-162; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057788236.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057788236.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057788236.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788236.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68066347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B64,B89,C40
`Chr1:68066470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr1:68066794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:68066889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr1:68067012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr1:68067313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:68067340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C78,C84
`Chr1:68067526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:68067592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr1:68067595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr1:68067636`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	80	A10,A11,A13,A18,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B105,B109,B112,B124,B129,B133,B138,B140,B17,B2,B24,B27,B28,B29,B31,B34,B36,B4,B44,B49,B54,B58,B59,B64,B67,B7,B71,B75,B77,B8,B80,B83,B86,B88,B90,B92,C14,C20,C24,C33,C34,C36,C4,C41,C42,C43,C47,C48,C51,C53,C58,C60,C62,C64,C66,C69,C73,C74,C75,C78,C80,C81,C82,C84,C85,D11,D4,D7
`Chr1:68067637`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	80	A10,A11,A13,A18,A2,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B105,B109,B112,B124,B129,B133,B138,B140,B17,B2,B24,B27,B28,B29,B31,B34,B36,B4,B44,B49,B54,B58,B59,B64,B67,B7,B71,B75,B77,B8,B80,B83,B86,B88,B90,B92,C14,C20,C24,C33,C34,C36,C4,C41,C42,C43,C47,C48,C51,C53,C60,C62,C64,C66,C69,C73,C74,C75,C78,C80,C81,C82,C84,C85,D11,D4,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788236.1

473 aa

236

473

p450

PF00067 p450 301-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788236.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	301	412	4.1e-13	49.6	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932253.1
TATGGTTGTCAAATCAAATTATTAATTAATTGGGGATGGACCTTGCATTAAACATTTTATTTGTTCAACAAAGAGCAGTGCCCCATCCTCCCCCTTGGCCTTCCATAATGTGACTGACAAACCTCAGATTATATATATCTCCTCAATTCTAGATTTCTTAATTATTCAATCCCCTCCCAATTAACCAAACAAATCCCTAATCTACCGACAATGTCCACAGCCCAGCTTCCGGCCCGAGAAATCCCCGGCGAGCACGGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005339
ATGTCCACAGCCCAGCTTCCGGCCCGAGAAATCCCCGGCGAGCACGGGCTCCCGTTTTTCGGGCCCATAAAAGACCGTTTCAGCTACTTCTACAGCCAAGGCGAGCTCAAATACTTCACAACCCGCATGGACAAATACCAATCCACGGTGTTCCGATGCAACATGCCGCCGGGCCCCTTCATGGCCCGAGACCCGCGCGTCGTCTGCCTCCTCGACGCCGTCAGCTTCCAGACCCTCTTCGACACCACCAAAGTCGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788236.1
MSTAQLPAREIPGEHGLPFFGPIKDRFSYFYSQGELKYFTTRMDKYQSTVFRCNMPPGPFMARDPRVVCLLDAVSFQTLFDTTKVDKRDVLDGTFMPSTAFTGGYRTCAYLDPSEPNHAILKGFFLSILAKKHDQFIPLFRQAMSGLFTGLEGDLAAKGSSSFNDLNDVMAFEFVFRLLCGVGPSETGLGPDGPKSMDLWLFGQLSPLMTLGIKYVPGFLEDFFLHNFPIPFFLVRSYYSKIYAAFEKNAGKLLEEAEEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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