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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005006`

染色体: Chr01 坐标: 68107762-68112735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005006`
名称	SmilChr01G005006
描述	probable CoA ligase CCL6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68107762 - 68112735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005350`
GeneID	`131005350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005350`
原始查询	`LOC131005350`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable CoA ligase CCL6
产物	probable CoA ligase CCL6
Arabidopsis	`AT1G49430` (LACS2) long-chain acyl-CoA synthetase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841367] identity=66.2; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0558300` - identity=68.1; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004467 (long-chain fatty acid-CoA ligase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006631 (fatty acid metabolic process); GO:0010025 (wax biosynthetic process); GO:0010143 (cutin biosynthetic process); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057788255.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788255.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788255.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057788255.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68108155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D5
`Chr1:68108284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B106,C38,D8
`Chr1:68109086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:68109225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D5
`Chr1:68109425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B28,D4
`Chr1:68110168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B138,D9
`Chr1:68110514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B28,B56,B96,D4
`Chr1:68110959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C16,C4,C43
`Chr1:68111119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B28,B56,B96,D4
`Chr1:68111319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B28,B56,B96,D4
`Chr1:68111321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788255.1

659 aa

330

659

AMP-binding

PF00501 AMP-binding 50-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788255.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	50	479	2.4e-79	267.6	AMP-binding enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932272.1
CCTTTATTTAGTTGAGATGTATTCCACCAAATTTATTATATCTCTATCTCTTTCTCTCACGCTTACGCTCCTCCAATTCTCAACTCTGTTTTTCCCACTTTTTCTCTAGAGGTGGAAAATGGGGGATTATGTGGTCAAGGTTGAGGAAGGGCGGCCGCCGGCCGACGGGAAGCCGTCGGTGGGGCCGGCCTACCGCTGCATTTATGCAAAGGATGGGCTCATGGAAATTCCACCTGCAATCAACTCTCCATGGGAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005350
ATGGGGGATTATGTGGTCAAGGTTGAGGAAGGGCGGCCGCCGGCCGACGGGAAGCCGTCGGTGGGGCCGGCCTACCGCTGCATTTATGCAAAGGATGGGCTCATGGAAATTCCACCTGCAATCAACTCTCCATGGGAATTTTTCAGTGAATCCGTGAAGAAATTTCCAAAGAACCCGATGCTAGGTCGCCGTCAAGTCAAGGATGGAAAGGCGGGTGCATACACTTGGCTAACTTACCAGCAAGTCTACGATACAACTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788255.1
MGDYVVKVEEGRPPADGKPSVGPAYRCIYAKDGLMEIPPAINSPWEFFSESVKKFPKNPMLGRRQVKDGKAGAYTWLTYQQVYDTTITIGSAMRRRGVNPGDKCGIYGVNSPEWIMAMEACNSQAITYVPLYDSLGANAVEFIINHAEVSIAFVHESKLPAILTCLSKCASTLKTIVSFGDISSKQQQAAEELGVACYSWEEFALLGNSDGDLPPKKKTDTLTIMYTSGTTGEPKGVILSNGAFMSEVMSMDQLLRETDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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