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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001369`

染色体: Chr01 坐标: 27040174-27042785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001369`
名称	SmilChr01G001369
描述	uncharacterized SmilChr01G001369
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27040174 - 27042785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005367`
GeneID	`131005367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005367`
原始查询	`LOC131005367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332]; symbol=AT3G51690; hit=AT3G51690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332]; symbol=AT3G51690; hit=AT3G51690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51690` (AT3G51690) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332] identity=42.1; qcov=0.509; evalue=8.41e-67; confidence=medium
Rice	`Os04g0357300` - identity=31.2; qcov=0.78; evalue=1.63e-52; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788286.1`
2	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057788286.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788286.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788286.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27040201`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A21,B66
`Chr1:27040201`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr1:27040251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:27040258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C74
`Chr1:27040830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B111,C43
`Chr1:27040832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:27040840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C37,C4,C69,C71
`Chr1:27040847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B103,B64,C30,C37
`Chr1:27040849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B65,B9,C11,C39
`Chr1:27040855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:27040883`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B79,C55,D10
`Chr1:27040883`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B79,C55,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788286.1

550 aa

275

550

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 99-227 aa PF21530 Pif1_2B_dom 354-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788286.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	99	227	1.8e-55	188.7	PIF1-like helicase
`XP_057788286.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	354	399	1.6e-19	70.0	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932303.1
ATGGCGGAGAGAGTGTGGGAACAAACTTGGCGATTGCTATCAGACGACATCATTCACATGAAGCGAAAGAGTCTTAAGAATCCAGATTTGCAGCTAACGGATGAGCAAATAAAAAATATCACGTTGGCTGAAATTGAAAAGTTACTCATTGCTAACTCCAGCAGTCTAATTCATTTTCCTGGCATGCCCACACCAAATGAAACTATTATCTCTGACGCTGAAAACCCGCTCATATTGGAAGAGACATCTTACAACATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005367
ATGGCGGAGAGAGTGTGGGAACAAACTTGGCGATTGCTATCAGACGACATCATTCACATGAAGCGAAAGAGTCTTAAGAATCCAGATTTGCAGCTAACGGATGAGCAAATAAAAAATATCACGTTGGCTGAAATTGAAAAGTTACTCATTGCTAACTCCAGCAGTCTAATTCATTTTCCTGGCATGCCCACACCAAATGAAACTATTATCTCTGACGCTGAAAACCCGCTCATATTGGAAGAGACATCTTACAACATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788286.1
MAERVWEQTWRLLSDDIIHMKRKSLKNPDLQLTDEQIKNITLAEIEKLLIANSSSLIHFPGMPTPNETIISDAENPLILEETSYNMEDMRAEHAKLYPCLTDEQMMVYQKIINAIDSGEGGLFFLYGHGGTGKIFIWKTLCSALRGRGDIVLPVASSGIASLLLPKGRTAHSRFGIPLDCDENSTCSKIKPDSDLTGLLKKTKLIIWDEAPMTHRYCFEALDRSLKDNCTSGSGAEDTKNFAQWILNVGDGIAGDTFDDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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