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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005113`

染色体: Chr01 坐标: 68903637-68905770 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005113`
名称	SmilChr01G005113
描述	AAA-ATPase At3g50940-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68903637 - 68905770 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005370`
GeneID	`131005370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005370`
原始查询	`LOC131005370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase At3g50940-like
产物	AAA-ATPase At3g50940-like
Arabidopsis	`AT3G50930` (BCS1) cytochrome BC1 synthesi [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824257] identity=50.6; qcov=0.911; evalue=2.98e-154; confidence=high
Rice	`Os01g0605100` - identity=45; qcov=0.87; evalue=1.19e-127; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF14363 (AAA_assoc); PF25568 (AAA_lid_At3g28540)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788289.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057788289.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788289.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057788289.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68903784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:68903805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:68903939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:68903942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:68903984`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	B10,B106,B119,B28,B54,B6,B66,B68,B8,B80,B81,B94,C16,C2,C22,C25,C36,C39,C47,C50,C52,C80,C86,C9,D4
`Chr1:68904002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:68904012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:68904322`	`TA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B19,B37,C15
`Chr1:68904326`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:68904326`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:68904337`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B19,B21,B37,B60,B75,C15
`Chr1:68904340`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B122,B19,B21,B37,B60,B75,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788289.1

529 aa

264

529

AAA_assoc

AAA

AAA_lid_At3g28540

PF14363 AAA_assoc 38-132 aa PF00004 AAA 255-395 aa PF25568 AAA_lid_At3g28540 397-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788289.1`	Pfam	`PF14363`	AAA_assoc	Family	38	132	3.5e-20	72.9	Domain associated at C-terminal with AAA
`XP_057788289.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	255	395	1.4e-22	81.2	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057788289.1`	Pfam	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	Domain	397	465	1.4e-15	57.7	At3g28540-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932306.1
CCAACGCCGAAGCCGCGTGGAAAATGCAATGCACCAATCACCAAATTTCAATTAAAATTCCTTCATTCCCACAAACATCAAATCCCCAAATCTGCTTGAATTGATTATCTGAGTGTACGAAGCATGAGTGCGATTTACTCGAACATCGATTTCCCCTCCGCCAAAGTCGTGCTCTCCACGGCGGCCTCCGTGGCGGCGACCCTCATGGTAGTCCGGTCTTTGGCCAAAGACCTCCTTCCCAACGAGCTACAACACTACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005370
ATGAGTGCGATTTACTCGAACATCGATTTCCCCTCCGCCAAAGTCGTGCTCTCCACGGCGGCCTCCGTGGCGGCGACCCTCATGGTAGTCCGGTCTTTGGCCAAAGACCTCCTTCCCAACGAGCTACAACACTACGTCTACACCAAATTCCACTACCTCCTCACTTCCGCATTCTCCAACGAGATTACCCTCGTCATCGACGAGTTCGACGGCCTCAACAAAAACCAGCTCTTCTCCGCCGCGGAGCTCTACGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788289.1
MSAIYSNIDFPSAKVVLSTAASVAATLMVVRSLAKDLLPNELQHYVYTKFHYLLTSAFSNEITLVIDEFDGLNKNQLFSAAELYAAAISSPSSRTYRVSLPEKEKKIRVFLGQNEEIVDEFCKTIHLKWRFVAEKSQRRRDYPSAATSSEIRSFKLTFHKKHKSKVIDEYLPYVLERSKALKEEKKTLKLHTLRSEKVHGPGITPWQSANLNHPAKFETLAMDDEIKSMIVDDLDRFLKRKELYRKIGKAWKRGYLLYGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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