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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005065`

染色体: Chr01 坐标: 68543297-68547046 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005065`
名称	SmilChr01G005065
描述	cyclase-associated protein 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68543297 - 68547046 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005382`
GeneID	`131005382`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005382`
原始查询	`LOC131005382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclase-associated protein 1
产物	cyclase-associated protein 1
Arabidopsis	`AT4G34490` (CAP1) cyclase associated protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829600] identity=71.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0722600` - identity=66.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003779 (actin binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007010 (cytoskeleton organization); GO:0008179 (adenylate cyclase binding); GO:0019933 (GO:0019933); GO:0045761 (regulation of adenylate cyclase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01213 (CAP_N-CM); PF08603 (CAP_C); PF21938 (CAP_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005382

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788316.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057788316.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788316.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057788316.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057788316.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68544003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B26,C40,C71
`Chr1:68544034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B110,B41,C78
`Chr1:68544063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B55
`Chr1:68544596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:68544631`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B109
`Chr1:68544631`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B109
`Chr1:68545011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:68545050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:68545281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:68545282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:68545318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:68545837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788316.1

475 aa

238

475

CAP_N-CM

CAP_N

CAP_C

PF01213 CAP_N-CM 3-39 aa PF21938 CAP_N 47-209 aa PF08603 CAP_C 315-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788316.1`	Pfam	`PF01213`	CAP_N-CM	Motif	3	39	8.3e-07	29.9	CAP N-terminal conserved motif
`XP_057788316.1`	Pfam	`PF21938`	CAP_N	Domain	47	209	3.1e-33	115.8	CAP, N-terminal domain
`XP_057788316.1`	Pfam	`PF08603`	CAP_C	Family	315	472	5.1e-61	205.6	Adenylate cyclase associated (CAP) C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932333.1
AACAAAAAGAATTATCTACGATTTTAGCAACTCAGACCATAAACATTCCAGTTGGACTTCAACCTCTCACCTTTCGGCGAAAAAACAAAATAAAAACTCCTTGAAAAAATTTGCGGACACACAGTAACACACACACCAACGAAGATCCGTTGTGTATGACTTCTGCAGACTGATTGAAGATTTTGTATTGACCGACTGTTGAACTGTTATGGAGGAGAGTTTGGTGAAGAGGCTCGAAGCCGCGGTGGCGCGGCTGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005382
ATGGAGGAGAGTTTGGTGAAGAGGCTCGAAGCCGCGGTGGCGCGGCTGGAGACGCTCTCGGTCGGAGGATTCCGGCAGGGGGTTGCGGCTGAGGACGGCGGAGGTGCGGCGGCGGCGGAAGATCCGTCGATTGTGGCGTTTGATGATCTGATTTCGCAGTGTGTTGGCAGAGTTACGAGCGCTGCGGAGAAGATTGGAGGACAGGTTCAGGATGTGTCTAAGGCAATCGCGGAAGCTTTTAGTGTGGAGAGGGAGCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788316.1
MEESLVKRLEAAVARLETLSVGGFRQGVAAEDGGGAAAAEDPSIVAFDDLISQCVGRVTSAAEKIGGQVQDVSKAIAEAFSVERELLVKIKQTQKPDMAGLIEFLKPLNEVISKASALTEGRRSDFAHHLKTGADSLAALGWIAYTGKDCGMSMPIAHVEESWQMAEFYCNKVLVEYRNKDANHVEWAKALKELYLPGLRDYVKAHYPLGPVWNATGKIAAAAPAKAPIRGAPAPPPPPPASLFSSETAQPSSSGPKEGM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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