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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005039`

染色体: Chr01 坐标: 68332443-68335388 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005039`
名称	SmilChr01G005039
描述	arabinosyltransferase RRA3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68332443 - 68335388 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005387`
GeneID	`131005387`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005387`
原始查询	`LOC131005387`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arabinosyltransferase RRA3-like
产物	arabinosyltransferase RRA3-like
Arabidopsis	`AT1G19360` (RRA3) Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838519] identity=70.4; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0587100` - identity=64.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity); GO:0080147 (root hair cell development)
KEGG	smil00514 (Other types of O-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03407 (Nucleotid_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005387

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057788326.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057788326.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788326.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788326.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68333448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:68333718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B53
`Chr1:68333787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B66
`Chr1:68333888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:68333999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,D5
`Chr1:68335022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:68335070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:68335117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788326.1

440 aa

220

440

Nucleotid_trans

PF03407 Nucleotid_trans 191-413 aa

XP_057788327.1

440 aa

220

440

Nucleotid_trans

PF03407 Nucleotid_trans 191-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788326.1`	Pfam	`PF03407`	Nucleotid_trans	Family	191	413	1.1e-48	166.8	Nucleotide-diphospho-sugar transferase
`XP_057788327.1`	Pfam	`PF03407`	Nucleotid_trans	Family	191	413	1.1e-48	166.8	Nucleotide-diphospho-sugar transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932343.1
AAAGTAGATCACAGTAATAATATTATAATCAGGAAATTAAAAAACAATGCGAGAAAATATCACGTTCAACGGCGGCCCAGGCTCAAAGTCTACTTCTCTGAGTCGCTGTAAAGAAATAATGCAGGCTACTATTTAGTTGAATTTATCAGCTGTTAATTATATTGTTGGTAATTATATTGTTGAATAATGCTATAGCAATAGCATACTGCAAATCCGCCGTGAGAAAGTGATGATTGGCGGTCGTAGAGAGGCCGCGCTGA...

XM_057932344.1
TAATATTATAATCAGGAAATTAAAAAACAATGCGAGAAAATATCACGTTCAACGGCGGCCCAGGCTCAAAGTCTACTTCTCTGAGTCGCTGTAAAGAAATAATGCAGGCTACTATTTAGTTGAATTTATCAGCTGTTAATTATATTGTTGGTAATTATATTGTTGAATAATGCTATAGCAATAGCATACTGCAAATCCGCCGTGAGAAAGTGATGATTGGCGGTCGTAGAGAGGCCGCGCTGATGAAGAAGGACGGCGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005387
ATGATTGGCGGTCGTAGAGAGGCCGCGCTGATGAAGAAGGACGGCGGCCAATCGCTGCGTAAATCGAGAATCGCTGCCGCGATCTTCGTCGGGATTTTACTCGGTTGCGTCTTCGCCTTCTTCTATCCGAACGGATTCTTCGTCTCATCGTCATCGCCGCTGAGTCGCCGCCTCGTCGCCGCCTCCGATCCGGAGGTTATTACTTCTTCATGTGAATCATCAGAACGCATCAACTTGTTGAAATCAGAGTTTGTCTCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788326.1
MIGGRREAALMKKDGGQSLRKSRIAAAIFVGILLGCVFAFFYPNGFFVSSSSPLSRRLVAASDPEVITSSCESSERINLLKSEFVSASEKNAELKRQVRELKEKLRFAEQGKDSAQKQVMVLGEQQKAGPFGTVKGLRTNPTVVPDESVNPKLAKLLEEVAVNREVIVTLANSNVKDMLEVWFKNIKRVGIPNYLVFALDEEIYSFCQSNDVPVYKKDVEEIKEDKNFESIARTGGNHAVSGLKFRILREFLQMGYSVLL...

XP_057788327.1
MIGGRREAALMKKDGGQSLRKSRIAAAIFVGILLGCVFAFFYPNGFFVSSSSPLSRRLVAASDPEVITSSCESSERINLLKSEFVSASEKNAELKRQVRELKEKLRFAEQGKDSAQKQVMVLGEQQKAGPFGTVKGLRTNPTVVPDESVNPKLAKLLEEVAVNREVIVTLANSNVKDMLEVWFKNIKRVGIPNYLVFALDEEIYSFCQSNDVPVYKKDVEEIKEDKNFESIARTGGNHAVSGLKFRILREFLQMGYSVLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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