当前解析结果
SmilChr01G001379| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001379 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001379 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001379 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 27187377 - 27188060 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005389 |
|---|---|
| GeneID | 131005389 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005389 |
| 原始查询 | LOC131005389 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT2G02650 (AT2G02650)Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=23; qcov=0.709; evalue=2.53e-06; confidence=weak |
| Rice | Os02g0118800- identity=28; qcov=0.85; evalue=2.51e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13966 (zf-RVT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005389 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057788337.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057788337.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057788337.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057788337.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057788337.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057788337.1PF13966
zf-RVT 32-124 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057788337.1 |
Pfam | PF13966 |
zf-RVT | Domain | 32 | 124 | 1.2e-12 | 49.0 | zinc-binding in reverse transcriptase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。