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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005063`

染色体: Chr01 坐标: 68531427-68535031 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005063`
名称	SmilChr01G005063
描述	guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68531427 - 68535031 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005395`
GeneID	`131005395`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005395`
原始查询	`LOC131005395`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2
产物	guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2
Arabidopsis	`AT4G34460` (AGB1) GTP binding protein beta 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829597] identity=83.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0669200` (OsWD40-80) - identity=81.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005834 (heterotrimeric G-protein complex); GO:0007186 (G protein-coupled receptor signaling pathway); GO:0030159 (signaling receptor complex adaptor activity)
KEGG	smil04081 (Hormone signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04082 (Neuroactive ligand signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF25391 (WD40_Gbeta)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005395

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788344.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788344.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788344.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788344.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788344.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68532118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:68532158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:68534477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B27,C47
`Chr1:68534667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:68534694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B20,C58,C85
`Chr1:68534714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B3,B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788344.1

377 aa

188

377

WD40_Gbeta

WD40

PF25391 WD40_Gbeta 51-368 aa PF00400 WD40 56-93 aa PF00400 WD40 108-135 aa PF00400 WD40 150-185 aa PF00400 WD40 201-233 aa PF00400 WD40 241-276 aa PF00400 WD40 296-323 aa PF00400 WD40 338-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF25391`	WD40_Gbeta	Repeat	51	368	1.2e-103	347.4	G protein beta WD-40 repeat protein
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	56	93	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	108	135	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	150	185	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	201	233	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	241	276	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	296	323	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788344.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	338	368	1.5e-53	177.6	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932361.1
ATATCCACGTCAGCAAGAAAGTGGGCCCGGCGGCTTCAGTCAGCTGCCCCCATAACCCAACGTCTCTCTCTCTCTTCTGTAAAGTCTTGGCAGTCCAACGCATTTCCTCAACTCCTCACGCAGCCTGTACACGCCCAAACCCCTTTCAATTCCTCAATACCTCTTGCCCAATCACACGATTCGACTCTCAATTGTGTGGAAATGCCAAAGCTAGGGTTCAAATGAAGCTAGACGGCTGAAATCTTCTTCTGCTTCCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005395
ATGTCCGTCGCTGAACTGAAGGAGCGGCACATGGCCGCCGCAGAAACCGTTAATTCCCTCAAGGAGAGATTAAAGCAGAAGCGCCTTCTCCTTCTCGACACTGATGTTGCCGGCTACGCCCGAGCGCAGGGACAAACTCGGGTGAGTTTTGGGCCGACTGATCTGGTTTGTTGCCGGACTCTTCAGGGGCACACGGGAAAGGTGTATTCGCTGGATTGGACTCCGGAAAGGAATCGTATAGTCAGTGCATCTCAAGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788344.1
MSVAELKERHMAAAETVNSLKERLKQKRLLLLDTDVAGYARAQGQTRVSFGPTDLVCCRTLQGHTGKVYSLDWTPERNRIVSASQDGRLIVWNALTSQKTHAIKLPCAWVMTCAFSPSGQSVACGGLDSMCSIFNLNSQTDKDGNLPVSRMLSGHKGYVSSCQYVPDEDTHLITASGDQTCVLWDITTGLRTSVFGGEFQSGHTADVLSVSINGSNSRMFISGSCDSTVRLWDTRVASRAVRTFHGHEGDVNTVKFFPDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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