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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005035`

染色体: Chr01 坐标: 68294367-68296484 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005035`
名称	SmilChr01G005035
描述	UPF0496 protein At4g34320-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68294367 - 68296484 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005396`
GeneID	`131005396`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005396`
原始查询	`LOC131005396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein At4g34320-like
产物	UPF0496 protein At4g34320-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=68.2; qcov=1; evalue=1.06e-174; confidence=high
Rice	`Os03g0199100` - identity=65.5; qcov=0.947; evalue=6.48e-157; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677); PF05633 (ROH1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005396

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788345.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788345.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788345.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788345.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788345.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68294706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:68294858`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr1:68294858`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr1:68294864`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr1:68294864`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr1:68295021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B123,B65,C38
`Chr1:68295129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:68295130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C65
`Chr1:68295189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr1:68295219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr1:68295272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:68295354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B90,B92,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788345.1

374 aa

187

374

DUF677

ROH1-like

PF05055 DUF677 41-368 aa PF05633 ROH1-like 64-159 aa

XP_057788346.1

374 aa

187

374

DUF677

ROH1-like

PF05055 DUF677 41-368 aa PF05633 ROH1-like 64-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788345.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	41	368	1.2e-130	436.0	Protein of unknown function (DUF677)
`XP_057788345.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	64	159	4.5e-08	33.3	Protein ROH1-like
`XP_057788346.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	41	368	1.2e-130	436.0	Protein of unknown function (DUF677)
`XP_057788346.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	64	159	4.5e-08	33.3	Protein ROH1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932362.1
TTCTGCAACACTCAGTTGCCAAATAAACAGTGACATCATCTCTTTCCTTTAAATTACCTTCTAATTTTCGGTGGTAAATTCCGCTCACTTGCATACAAAGTCTCACAGTCTTTCTTCGGAATCTTCAGCTATGGCGTAACTTCTCAAAGTCGTGTTCCTTTACGCGTTGCAGCTTTGCAACACTCTCGAGTGGTATCTGCTGCGCGATTGCACATTTCAAGGGTTTGAAACTGCGCTTAATTTGTTGCTGAATTTCTATG...

XM_057932363.1
ATTCCGCTCACTTGCATACAAAGTCTCACAGTCTTTCTTCGGAATCTTCAGCTATGGCGTAACTTCTCAAAGTCGTGTTCCTTTACGCGTTGCAGCTTTGCAACACTCTCGTATTTTTCTCTTTCTCTCTCTCCCTCTAATTACATTATACTACGTATAAAATTGAGAAATTGTGTTGCTGCAAGATAAATGGCGCTTCTTCCACCTCTTTTACTTTCTGAAAAAGGAGTGGTATCTGCTGCGCGATTGCACATTTCAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005396
ATGGGGAGCCACATGAGCAAGAGCCATGGAGAAACCTCTGCTGCAAACGACATCAACAATCTGCACTTCGCAACCGAGCTGCACTCATATGAGGCGGCGTGCAAGGTTGACGCTGACGTACAAGCCTTCGATGCGGCCCTCCATTACCGAACGAACAATGCGATCAGTGCCCTAGCTGCTGGAGTTGAGGTCAAGGCAATGTCGTTTGACTCCCTCCGAGAAGTCACGGCTTGCCTGCTCGACATGAATCAGGAAGTGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788345.1
MGSHMSKSHGETSAANDINNLHFATELHSYEAACKVDADVQAFDAALHYRTNNAISALAAGVEVKAMSFDSLREVTACLLDMNQEVVKVILDCKKDIWKNQELFEFVEEYFENSLKILDFCTALEKCLKSARDRQLLIHIALQQFEEEEEEGVGDGRYTKTLLELRNFKEAGDPFTEEFFKIFESVYRQQMVMLERLQSRKNKLDKKLKSVHAWRKVSTVIFAATFAAVLICSVVAAAMAAPPVAAALAAAASVPLGSMG...

XP_057788346.1
MGSHMSKSHGETSAANDINNLHFATELHSYEAACKVDADVQAFDAALHYRTNNAISALAAGVEVKAMSFDSLREVTACLLDMNQEVVKVILDCKKDIWKNQELFEFVEEYFENSLKILDFCTALEKCLKSARDRQLLIHIALQQFEEEEEEGVGDGRYTKTLLELRNFKEAGDPFTEEFFKIFESVYRQQMVMLERLQSRKNKLDKKLKSVHAWRKVSTVIFAATFAAVLICSVVAAAMAAPPVAAALAAAASVPLGSMG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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