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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001381`

染色体: Chr01 坐标: 27198788-27199746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001381`
名称	SmilChr01G001381
描述	uncharacterized SmilChr01G001381
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27198788 - 27199746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005397`
GeneID	`131005397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005397`
原始查询	`LOC131005397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=33.1; qcov=0.577; evalue=4.52e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.8; qcov=0.822; evalue=1.94e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788349.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788349.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057788349.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788349.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27198805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D11
`Chr1:27198819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr1:27198842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B25,B55,D5
`Chr1:27198863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A16,A4,B12,B121,B128,B129,B130,B131,B22,B31,B38,B39,B42,B43,B5,B60,B79,B82,B92,C12,C14,C19,C2,C25,C29,C3,C31,C33,C46,C47,C49,C50,C52,C71,C79,D10
`Chr1:27198865`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C2,D11
`Chr1:27198865`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C2,D11
`Chr1:27198866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B112,B81,C79
`Chr1:27198869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A16,A4,B12,B121,B128,B129,B130,B131,B22,B31,B38,B39,B42,B43,B5,B60,B79,B82,B92,C12,C14,C19,C2,C25,C29,C3,C31,C33,C46,C47,C49,C50,C52,C71,C79,D10
`Chr1:27198872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B48,D5
`Chr1:27198889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D11
`Chr1:27198918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B15,C30
`Chr1:27198929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788349.1

241 aa

120

241

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 47-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788349.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	47	140	1e-19	71.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932366.1
ATGAGGTCGGGGTGGTGGAAGAAGGTGTTGGAGTTAAGTCGGGGAGAAAATGGGAGATGGTTTAGAGAAAACGTGGCTGTCCGGATTGGGGAAGGAACACAAGACGGATGGAGTTGGCTGGCCGATCCGAAAGGAAAATTCTCGGTTAATTCGGCATATAGAACCCTCTGTCAGTTCACAGGTCCAGGAAGAAATACTAGCAAAGCGCCGGAGTTTCTCTTGATTTGGAAAGCACCAGCTCCATTCAAGGCAAAAACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005397
ATGAGGTCGGGGTGGTGGAAGAAGGTGTTGGAGTTAAGTCGGGGAGAAAATGGGAGATGGTTTAGAGAAAACGTGGCTGTCCGGATTGGGGAAGGAACACAAGACGGATGGAGTTGGCTGGCCGATCCGAAAGGAAAATTCTCGGTTAATTCGGCATATAGAACCCTCTGTCAGTTCACAGGTCCAGGAAGAAATACTAGCAAAGCGCCGGAGTTTCTCTTGATTTGGAAAGCACCAGCTCCATTCAAGGCAAAAACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788349.1
MRSGWWKKVLELSRGENGRWFRENVAVRIGEGTQDGWSWLADPKGKFSVNSAYRTLCQFTGPGRNTSKAPEFLLIWKAPAPFKAKTTVWRLLRGRMATCDNLLRRQVITQNTESDCMLCKEQTESSEHLFFRCPATSEIWYALLLWLGKQSALQSKVKEHLLAFTNLGEKSDTSLLLCIWICSVWCIWKERNECKFNQGVWKNEKLVAEIKSRVWGWIMAYDVQSRFTDFRTWFTDVKLLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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