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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001394`

染色体: Chr01 坐标: 27433553-27434749 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001394`
名称	SmilChr01G001394
描述	F-box protein At5g49610-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27433553 - 27434749 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005414`
GeneID	`131005414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005414`
原始查询	`LOC131005414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g49610-like
产物	F-box protein At5g49610-like
Arabidopsis	`AT5G49610` (AT5G49610) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835023] identity=25.8; qcov=1.02; evalue=7.07e-13; confidence=low
Rice	`Os09g0479100` (OsFbox492) - identity=27.6; qcov=0.719; evalue=1.95e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788388.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788388.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788388.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788388.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27433559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:27433848`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr1:27433848`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr1:27434001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B127,C1
`Chr1:27434139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C38
`Chr1:27434237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:27434321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:27434348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:27434423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:27434439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:27434453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B50,C40
`Chr1:27434462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B23,B93,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788388.1

398 aa

199

398

F-box

F-box-like

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 8-43 aa PF12937 F-box-like 9-41 aa PF08268 FBA_3 110-276 aa PF07734 FBA_1 124-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788388.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	8	43	9.6e-10	38.7	F-box domain
`XP_057788388.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	9	41	2.2e-06	28.0	F-box-like
`XP_057788388.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	110	276	1.4e-10	41.4	F-box associated beta propeller domain
`XP_057788388.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	124	334	1.4e-12	47.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932405.1
ATGGATCCTATTCCGAGCAACAACGATGTTGTGACAGAAATCCTCTTGCATCTACCCACAAAATCCCTCTTGAGATTCAGAGCCGTCTGCAAATCATGGCGTGACTCGATCGATTCTCGAGCTTTTAGAAAATCGCACACTCAGCAACACGAAGAAGAAGAAGACGATGATGATACGGCGCTTCTGCAATTCAGTTTTCACCGAGATAGGGTTTCACAACTGTCAATGATGTTCCCACCTAACGGCAGCTCGTACAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005414
ATGGATCCTATTCCGAGCAACAACGATGTTGTGACAGAAATCCTCTTGCATCTACCCACAAAATCCCTCTTGAGATTCAGAGCCGTCTGCAAATCATGGCGTGACTCGATCGATTCTCGAGCTTTTAGAAAATCGCACACTCAGCAACACGAAGAAGAAGAAGACGATGATGATACGGCGCTTCTGCAATTCAGTTTTCACCGAGATAGGGTTTCACAACTGTCAATGATGTTCCCACCTAACGGCAGCTCGTACAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788388.1
MDPIPSNNDVVTEILLHLPTKSLLRFRAVCKSWRDSIDSRAFRKSHTQQHEEEEDDDDTALLQFSFHRDRVSQLSMMFPPNGSSYNNFPALAEFFDDHLKPAVTLTETGREVTERGSFVRIVGPVNGLICIHHRNSNGPIAVCNPSLGKINILPVSPACSFHQNHRRTIDRDVGIGFDEAAQDYKVVQVLSCRGHRGFHASVYSRATDSWRELGRGGVIDHDQLYIRSPIKSSRKNGSFSHWLAIRKVGGDEYEHEMVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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