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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005083`

染色体: Chr01 坐标: 68709707-68710950 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005083`
名称	SmilChr01G005083
描述	glycine-rich RNA-binding protein blt801-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68709707 - 68710950 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005438`
GeneID	`131005438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005438`
原始查询	`LOC131005438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein blt801-like
产物	glycine-rich RNA-binding protein blt801-like
Arabidopsis	`AT4G39260` (CCR1) cold, circadian rhythm, and RNA binding 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830082] identity=73.6; qcov=0.526; evalue=4.17e-46; confidence=medium
Rice	`Os03g0670700` (OsGRP3) - identity=80.5; qcov=0.503; evalue=7.89e-47; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF16367 (RRM_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788423.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788423.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057788423.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057788423.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057788423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68710391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,D10
`Chr1:68710394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:68710457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B123,B129,B65
`Chr1:68710473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B139,B7,B88
`Chr1:68710497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:68710533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:68710544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:68710564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B52
`Chr1:68710567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:68710568`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A20,B125,B7,C58
`Chr1:68710568`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A20,B125,B7,C58
`Chr1:68710574`	`CG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,B7,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788423.1

173 aa

173

RRM_7

RRM_1

PF16367 RRM_7 9-72 aa PF00076 RRM_1 11-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788423.1`	Pfam	`PF16367`	RRM_7	Domain	9	72	2.2e-06	28.2	RNA recognition motif
`XP_057788423.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	11	79	1.6e-24	86.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932440.1
ATTGTTCCAATCTTAGCCGCCCCAAGACACGGCGACAGCTGCCGAAAACACTGTTTCTTAACCACGGTTGCGTAACTAACTAACCCTAGCGCACTGCGCACCCCGCTCATATTACCCTTCTCCCACCCAACCCAAGATTACTTAGCCATCTCCGCCTATATATATCGCCGTTTCCCACTCTCTCTTCTCATTAGCTCTCCTATTTTCCTTCTTCCTTATCGTTTCAGTTCTTTAATTCCTCCTTTAATCGTAGAAATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005438
ATGGCTGCCGCCGATGTTGAATTCAGATGTTTCGTTGGTGGTTTGGCTTGGGCCACCACCGAGCACTCGCTCGAGCAAGCTTTCTCTCAGTACGGCCAAGTCGTCGATTCGAAGATCATCAACGATCGGGAGACCGGAAGGTCGAGGGGATTCGGATTCGTGACGTTTAGAGATGAGCAATCGATGAGGGATGCGATCGATGCGATGAACGGTCAGGATCTGGACGGCCGTAGTATAACCGTCAACGAGGCTCAGTCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788423.1
MAAADVEFRCFVGGLAWATTEHSLEQAFSQYGQVVDSKIINDRETGRSRGFGFVTFRDEQSMRDAIDAMNGQDLDGRSITVNEAQSRGGGGGGGGGGFRGPRREGSGGYGGGNGGGYGGGNGGGYGRREGGNGGGYGRREGGSGGYGGRSGGYGGGGDRSYSRSGGSDGNWRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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