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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G005137

染色体: Chr01 坐标: 69160820-69162997 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G005137
名称SmilChr01G005137
描述uncharacterized SmilChr01G005137
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向69160820 - 69162997 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131005468
GeneID131005468
locus_tag-
NCBI NameLOC131005468
原始查询LOC131005468

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述cytochrome c oxidase 19-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843311]; symbol=COX19-2; hit=AT1G69750; species=arabidopsis; confidence=medium
产物cytochrome c oxidase 19-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843311]; symbol=COX19-2; hit=AT1G69750; species=arabidopsis; confidence=medium
ArabidopsisAT1G69750 (COX19-2)
cytochrome c oxidase 19-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843311]
identity=67.4; qcov=1; evalue=3.16e-44; confidence=medium
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131005468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 1.00000 XP_057788449.1
2 Mitochondrion intermembrane space Mitochondrion intermembrane space 1.00000 XP_057788449.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057788449.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057788449.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057788449.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057932466.1
CCATAGACATGGGCCAAATAAAAGCATAATGAGCACGAACGACTGGGCTCTAATTCCCGGCCCAAATATTTAATCTGTGAAAGATAAATCTGTTTCCTTCCTAATTCATCTCTGTTTCAATTTCAAATTTCCGATTAATCGGCGGTCGATTTTGCCGATTAAACGCCATTATCTCCGACTATCAGAGCCGTTTTTAAAGCCTGAGAATTGAAAACTCATACGAGAGAATATCTTCCAAAAGAACTGAAGAAATAGACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131005468
ATGAGTGCAGGAGGTGCATTTGGTGGAAATAGAGGAGCAAGACCAGTGCCACCAGAAAAAGGAGTTTTCCCTTTGGACCATATGCATCTGTGTGACCTGGAAAAGAAAGAGTACATTAACTGTTTGAAGACTGAGGGCCATAAATCTGATAAATGTAGACAATTCTCCAAGAAGTACCTGGAGTGTCGTATGGATAAGAATTTGATGGCAAAACAAGATATGTCAGAACTTGGATTTGGGAGAGGAGATGAATTGCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057788449.1
MSAGGAFGGNRGARPVPPEKGVFPLDHMHLCDLEKKEYINCLKTEGHKSDKCRQFSKKYLECRMDKNLMAKQDMSELGFGRGDELQAPPNED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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