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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005141`

染色体: Chr01 坐标: 69196541-69199173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005141`
名称	SmilChr01G005141
描述	cysteine protease RD19A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69196541 - 69199173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005474`
GeneID	`131005474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005474`
原始查询	`LOC131005474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine protease RD19A-like
产物	cysteine protease RD19A-like
Arabidopsis	`AT4G39090` (RD19) Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830064] identity=76.2; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0469600` - identity=71.9; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057788454.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788454.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788454.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788454.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69196754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B13,B137,B9
`Chr1:69196775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:69196802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B137,B9
`Chr1:69196807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C76
`Chr1:69197112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:69198473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69198728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69198781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A3,B41,C40,C76
`Chr1:69198816`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr1:69198816`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr1:69198820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B137
`Chr1:69198930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B25,B5,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788454.1

375 aa

188

375

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 60-116 aa PF00112 Peptidase_C1 144-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788454.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	60	116	3.1e-14	53.7	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057788454.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	144	367	3.8e-75	253.4	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932471.1
GGAGGAACTGCGCGCAGTGACCAACCCAAGAAGCAACCGCTACTCCTTCGGCCCAATGAAACTCCACCACGTGTCTTATCCTCATTGGTTTTCTAATCTCCTTTTCCACTACCCCGAGCTCGCCTTTTCACTGTATATATATCTCCCACGCATTAGAGAATAACGTAGAGTGCTCGAATTTTGCCATGGCTTCACGCTTTCCCTTCATTCTCTCCTCTCTCCTCATTGCGGCGTCGTGTTGGTGTTCCGCCGCCGTCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005474
ATGGCTTCACGCTTTCCCTTCATTCTCTCCTCTCTCCTCATTGCGGCGTCGTGTTGGTGTTCCGCCGCCGTCGACGGCGGCGCTCTAGAGAGTAACGATCCTCTGATTCGGCAAGTGGTAGACCACGGCGAGGGCGCAGCCACCGGCGATAACGAGTTGCTGAACGACGATCACCATTTCGCGATATTTAAGAGTAGATTCAGCAAGTCCTACGCTTCACAGGAGGAGCACGATCACAGGTTCTCGGTGTTCAAGGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788454.1
MASRFPFILSSLLIAASCWCSAAVDGGALESNDPLIRQVVDHGEGAATGDNELLNDDHHFAIFKSRFSKSYASQEEHDHRFSVFKANLRRARRHQKLDPSAVHGVTPFSDLTPREFRNRFLGINRRLRLPSDAHQAPVLPTNDLPKDFDWRDHGAVTAVKNQGSCGSCWSFSTTGALEGANYLATGKLLSLSEQQLVECDHECDPEEKDSCDSGCNGGLMNSAFEYTLKAGGLMREEDYPYTGTDRGTCKFDKSKVVAKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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