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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001423`

染色体: Chr01 坐标: 27855158-27861667 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001423`
名称	SmilChr01G001423
描述	receptor-like protein 12
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27855158 - 27861667 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005475`
GeneID	`131005475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005475`
原始查询	`LOC131005475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 12
产物	receptor-like protein 12
Arabidopsis	`AT1G71400` (RLP12) receptor like protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843481] identity=35.4; qcov=0.816; evalue=3.34e-117; confidence=medium
Rice	`Os01g0163000` - identity=34.3; qcov=0.934; evalue=3.07e-130; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788457.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057788457.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788457.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788457.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27855170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr1:27855176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:27855183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B9,C3,C46
`Chr1:27855198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr1:27855204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,A23,B29
`Chr1:27855218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A16,A23,B29,C37,C69
`Chr1:27855218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A23,B29,C37,C69
`Chr1:27855269`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A3,A4,B10,B102,B107,B110,B114,B117,B122,B128,B139,B140,B15,B16,B17,B22,B3,B30,B34,B37,B38,B39,B42,B43,B46,B48,B51,B52,B59,B61,B63,B65,B68,B8,B9,B90,B92,B93,C15,C24,C26,C30,C31,C38,C42,C44,C45,C47,C5,C50,C54,C56,C60,C65,C70,C72,C73,C74,C82,C85,C86,D1,D5,D9
`Chr1:27855282`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C28,C75
`Chr1:27855282`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C28,C75
`Chr1:27855290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:27855309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C27,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788457.1

1034 aa

517

1034

LRRNT_2

LRR_1

LRR_14

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 199-240 aa PF00560 LRR_1 374-396 aa PF23598 LRR_14 374-578 aa PF13855 LRR_8 421-481 aa PF00560 LRR_1 422-444 aa PF13855 LRR_8 446-506 aa PF00560 LRR_1 471-492 aa PF13516 LRR_6 571-584 aa PF00560 LRR_1 571-590 aa PF00560 LRR_1 616-637 aa PF13516 LRR_6 639-653 aa PF00560 LRR_1 640-659 aa PF00560 LRR_1 663-681 aa PF00560 LRR_1 686-708 aa PF13855 LRR_8 829-881 aa PF00560 LRR_1 846-868 aa PF00560 LRR_1 870-891 aa PF00560 LRR_1 895-911 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	199	240	2.2e-08	34.9	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	374	396	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	374	578	7.2e-28	98.1	Leucine-rich repeat region
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	421	481	4.2e-44	148.9	Leucine rich repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	422	444	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	446	506	4.2e-44	148.9	Leucine rich repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	471	492	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	571	584	8.2e-12	44.9	Leucine Rich repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	571	590	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	616	637	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	639	653	8.2e-12	44.9	Leucine Rich repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	640	659	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	663	681	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	686	708	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	829	881	4.2e-44	148.9	Leucine rich repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	846	868	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	870	891	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057788457.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	895	911	2.4e-48	152.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932474.1
ATGAACAACGTCGTTTTTGTGACGCGATTGAATGGCGGTGCGAAAGGCTGTTGCTATTTACAGGCAATTTGCGAAGGTGATAATGACCAGTTCAATGGTTTCTCTCTTGACCTTTCATTTTTGGGCATATCCCATGGTTACGTTGAGGCTAGTAACTGTGGTGGGGTTTTCTGTTTCAATGCTTTTAATGGTTGGATTGTTCTGTGCAACCCGCTTGCAAACACCCTCAAATTCCTTCCCCCGACCCTCCCCCCTCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005475
ATGAACAACGTCGTTTTTGTGACGCGATTGAATGGCGGTGCGAAAGGCTGTTGCTATTTACAGGCAATTTGCGAAGGTGATAATGACCAGTTCAATGGTTTCTCTCTTGACCTTTCATTTTTGGGCATATCCCATGGTTACGTTGAGGCTAGTAACTGTGGTGGGGTTTTCTGTTTCAATGCTTTTAATGGTTGGATTGTTCTGTGCAACCCGCTTGCAAACACCCTCAAATTCCTTCCCCCGACCCTCCCCCCTCCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788457.1
MNNVVFVTRLNGGAKGCCYLQAICEGDNDQFNGFSLDLSFLGISHGYVEASNCGGVFCFNAFNGWIVLCNPLANTLKFLPPTLPPPPLSYIRFYNCGFCYDAKSDDHKVIRIFDVVDPEKEDGITRYCRPTTKSELFSFRRVIFYSGFGEFIKAFEVWEYGIDGEWSKLYDDAIIINVEKPLNLNGSLITHSYNTQCLDDQKTLLLQFKNDLTFDSSLSTKLVRWNESDECCKWAGVECDAAGYVISLQLDDESISGGIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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