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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005146`

染色体: Chr01 坐标: 69247695-69250544 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005146`
名称	SmilChr01G005146
描述	B-box zinc finger protein 20-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69247695 - 69250544 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005478`
GeneID	`131005478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005478`
原始查询	`LOC131005478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B-box zinc finger protein 20-like
产物	B-box zinc finger protein 20-like
Arabidopsis	`AT1G75540` (BBX21) salt tolerance homolog2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843890] identity=56.1; qcov=1.01; evalue=1.4e-64; confidence=high
Rice	`Os04g0540200` (OsBBX13) - identity=50.3; qcov=0.979; evalue=1.68e-60; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009640 (photomorphogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF00643 (zf-B_box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788459.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057788459.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788459.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788459.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788459.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69249085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:69249119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:69249380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B5
`Chr1:69249387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:69249494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B8
`Chr1:69249522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:69249584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B123,B140,B65,B93
`Chr1:69249650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:69249651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B66,B77,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788459.1

206 aa

103

206

zf-B_box

PF00643 zf-B_box 3-45 aa PF00643 zf-B_box 54-97 aa

XP_057788460.1

195 aa

195

zf-B_box

PF00643 zf-B_box 3-45 aa PF00643 zf-B_box 54-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788459.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	3	45	6.7e-17	62.1	B-box zinc finger
`XP_057788459.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	54	97	6.7e-17	62.1	B-box zinc finger
`XP_057788460.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	3	45	7.4e-17	62.0	B-box zinc finger
`XP_057788460.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	54	97	7.4e-17	62.0	B-box zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932476.1
TAAGATACATATATCATATTTAATTTCACAAGTCACGAAAGATATTAAAAATAACAAAACAAAAATAATTCAAAAATCCACCTAAAAATATCTCAATGACAGAAAACCACTCGCCCCACGTAGGAAGAAATAAACAAAAAAGAAAAGAAGACAAAAGAAAGTCTTATCTTTTAGATTTAGATTTTTTAAGATACAGGTGTAGACAGAGAGAAAATCAATCATAATGCAGAAATTTGTTGGTTGGGAAGTATTAATTCTTT...

XM_057932477.1
TAAGATACATATATCATATTTAATTTCACAAGTCACGAAAGATATTAAAAATAACAAAACAAAAATAATTCAAAAATCCACCTAAAAATATCTCAATGACAGAAAACCACTCGCCCCACGTAGGAAGAAATAAACAAAAAAGAAAAGAAGACAAAAGAAAGTCTTATCTTTTAGATTTAGATTTTTTAAGATACAGGTGTAGACAGAGAGAAAATCAATCATAATGCAGAAATTTGTTGGTTGGGAAGTATTAATTCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005478
ATGAAGATTCAATGCGACGTTTGTGGGAAAGAAGCAGCAGCCGTATTCTGCACAGCCGATGAAGCCGCCCTCTGCCAGAATTGCGACAACCGAGTTCATAACGCCAATAAGCTCGCGAGCAAGCATCCTCGTTTCTCTCTTCTTAATCCTCAGTTGAAAGAATCTCCACGCTGCGACATTTGCCAGGAAAGACAAGCGTTACTGTTTTGTCAAGAAGACAGGGCTTTACTTTGTCGAGAATGTGATGTACCAATACACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788459.1
MKIQCDVCGKEAAAVFCTADEAALCQNCDNRVHNANKLASKHPRFSLLNPQLKESPRCDICQERQALLFCQEDRALLCRECDVPIHKANELTKKHNRFLLTGVKLSAAISSYQGATSSSGSQSGIEFRTSVANANSNNANCSETSSNPTRENESSLPTGEQASDSTSSISEYLMETLPGWHVEDLMDPSSHYRYCKIDKQVLSLSD

XP_057788460.1
MKIQCDVCGKEAAAVFCTADEAALCQNCDNRVHNANKLASKHPRFSLLNPQLKESPRCDICQERQALLFCQEDRALLCRECDVPIHKANELTKKHNRFLLTGVKLSAAISSYQGATSSSGSQSGIEFRTSVANANSNNANCSETSSNPTRENESSLPTGEQASDSTSSISEYLMETLPGWHVEDLMDPSSHYRYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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