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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005155`

染色体: Chr01 坐标: 69324633-69326962 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005155`
名称	SmilChr01G005155
描述	uncharacterized SmilChr01G005155
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69324633 - 69326962 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005487`
GeneID	`131005487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005487`
原始查询	`LOC131005487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816674]; symbol=AT2G21350; hit=AT2G21350; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816674]; symbol=AT2G21350; hit=AT2G21350; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G21350` (AT2G21350) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816674] identity=43.5; qcov=0.913; evalue=3.64e-45; confidence=medium
Rice	`Os10g0512500` - identity=57.9; qcov=0.496; evalue=4.86e-44; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788472.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057788473.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788472.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788472.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69325135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:69325152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B140,B49,C60
`Chr1:69325203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,C28,C37,C38,C8
`Chr1:69325250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:69325922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B37,C70
`Chr1:69325958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B108,C23
`Chr1:69325997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B140,B49,C6,C60
`Chr1:69326007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:69326512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,C28,C37,C38,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788472.1

263 aa

132

263

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 121-207 aa

XP_057788473.1

254 aa

127

254

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 121-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788472.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	121	207	6.6e-20	71.9	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057788473.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	121	207	6e-20	72.1	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932489.1
GGGACCTCTCGCACCCGAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAGCACCCGTTGATGATTACATCCTCATTGTATGATATTTGATTCATTTAATTTGGCCGATTATATAAAGCCGTTTTCTTCCAAAGAGATTGAATTCTTTTAAAGCGGAAATGGCTACGCTGGCCTCCTTTTCCCCGCACCTGATACTGCACCGTCTTATCCGCCGCCCCGCCGCGCCTTCGTGTCTCCGCGCCGCCGTATTTTCCCAATCCAACAAAT...

XM_057932490.1
TTCCAAAGAGATTGAATTCTTTTAAAGCGGAAATGGCTACGCTGGCCTCCTTTTCCCCGCACCTGATACTGCACCGTCTTATCCGCCGCCCCGCCGCGCCTTCGTGTCTCCGCGCCGCCGTATTTTCCCAATCCAACAAATCCTTTCCTCTCCTCCGTGCGGCGCCATTGTTCACCTCCTCTCGGTTCATCTTCTCCTCTTTCTCGTCCTCGTCGCACTCAATTCCGCAGCAGCAGTTTGCAATTGATGCAGCTTTGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005487
ATGGCTACGCTGGCCTCCTTTTCCCCGCACCTGATACTGCACCGTCTTATCCGCCGCCCCGCCGCGCCTTCGTGTCTCCGCGCCGCCGTATTTTCCCAATCCAACAAATCCTTTCCTCTCCTCCGTGCGGCGCCATTGTTCACCTCCTCTCGGTTCATCTTCTCCTCTTTCTCGTCCTCGTCGCACTCAATTCCGCAGCAGCAGTTTGCAATTGATGCAGCTTTGCTGGAGGATGTACAAACTGAATCGGAAGGGGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788472.1
MATLASFSPHLILHRLIRRPAAPSCLRAAVFSQSNKSFPLLRAAPLFTSSRFIFSSFSSSSHSIPQQQFAIDAALLEDVQTESEGEIDADSASAVAEVSNSEVIKTAPRPPLPPPPPPPSLSVKEKKELASFAHSLGKKLKSQQVGKSGVTETVIGALIETLEKNELLKLKIHGTCPGEFEDVVKELEESTGSVVVGQIGRTVILYRPSLSKLIAEEKKKQVQRDFLRRQAAFKQSPQSRRPAAAPGQEPRQAGRGRRGT...

XP_057788473.1
MATLASFSPHLILHRLIRRPAAPSCLRAAVFSQSNKSFPLLRAAPLFTSSRFIFSSFSSSSHSIPQQQFAIDAALLEDVQTESEGEIDADSASAVAEVSNSEVIKTAPRPPLPPPPPPPSLSVKEKKELASFAHSLGKKLKSQQVGKSGVTETVIGALIETLEKNELLKLKIHGTCPGEFEDVVKELEESTGSVVVGQIGRTVILYRPSLSKLIAEEKKKQVQRDFLRRQAAFKQSPQETSSGARARTKTSWSW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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