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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005156`

染色体: Chr01 坐标: 69327137-69332560 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005156`
名称	SmilChr01G005156
描述	protein DETOXIFICATION 46, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69327137 - 69332560 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005488`
GeneID	`131005488`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005488`
原始查询	`LOC131005488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DETOXIFICATION 46, chloroplastic
产物	protein DETOXIFICATION 46%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G21340` (AT2G21340) MATE efflux family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816673] identity=66.5; qcov=0.905; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0122200` - identity=67.1; qcov=0.722; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015297 (antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0042910 (xenobiotic transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01554 (MatE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005488

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788474.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057788474.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788474.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788474.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788474.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69327609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:69329494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B137,C10,C17
`Chr1:69329570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:69330194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C36,C82
`Chr1:69331442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69331596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:69332178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:69332326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C10,C17
`Chr1:69332398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788474.1

547 aa

274

547

MatE

PF01554 MatE 113-268 aa PF01554 MatE 332-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788474.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	113	268	1e-20	74.8	MatE
`XP_057788474.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	332	488	1e-20	74.8	MatE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932491.1
AGTATTATATATTGTGTGCGTGTAATACTAGTATTTGTATTTCATTTTCTTTTTTATTTCAACGCCGCTCCCCAACGTCCCTTCATTCGTCTCATCATTTGGCGCCTCTCTCTCTCTCTCAACTGCAGGGCACGAAATTGTGCAGCATGAATCTAAGGGCGCCAATTCACCATCCACACCACCTTAATCCGCCAACCCTAAACAGAAGATTCAATCGAGTTTCCACTCTATCTACACCCATTCTCCGATTCTCGAAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005488
ATGAATCTAAGGGCGCCAATTCACCATCCACACCACCTTAATCCGCCAACCCTAAACAGAAGATTCAATCGAGTTTCCACTCTATCTACACCCATTCTCCGATTCTCGAAGCAAAAAAACAATACGAATTTAATTTTCAATTGCATTTCTCCGAGCAATGAAGTTGCAGAAAGCATTGCTCGAATCTCATCAACTGAGGAAGGAAACGACGAGATATTAGCTGCAGTCGAGAAAACGCAGCTGTCAGAAGAGGTTTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788474.1
MNLRAPIHHPHHLNPPTLNRRFNRVSTLSTPILRFSKQKNNTNLIFNCISPSNEVAESIARISSTEEGNDEILAAVEKTQLSEEVSEINIDELSENDSLWIQMVEIAKFSGPAAGLWICAPLMSLIDTAVIGQCSSIELAALGPGTVFCDYTSYVFMFLSIATSNLVATSLARKDKNEVQHQISNLLCVGLACGFLMLFFTRCFGSWGLTAFTGANNPEIIAAANTYVQIRGLAWPAVLIGWVAQSASLGMKDSWGPLKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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