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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001428`

染色体: Chr01 坐标: 27921465-27924019 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001428`
名称	SmilChr01G001428
描述	uncharacterized SmilChr01G001428
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27921465 - 27924019 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005490`
GeneID	`131005490`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005490`
原始查询	`LOC131005490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.3; qcov=0.631; evalue=5.04e-44; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=32.7; qcov=0.63; evalue=8.53e-47; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005490

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788479.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788479.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788479.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788479.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27921476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:27921527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C79
`Chr1:27921571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr1:27921578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B136
`Chr1:27921594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B127,B13
`Chr1:27921644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:27921687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C77
`Chr1:27921688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C9
`Chr1:27921693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C44
`Chr1:27921693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:27921696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A15,A4,B124,B130,B135,B17,B25,B60,B65,B66,B69,C10,C16,C20,C47,C74,C77,C78,D5
`Chr1:27921717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B110,B112,B71,B88,C22,C32,C61,C62,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788479.1

621 aa

310

621

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 410-503 aa PF00872 Transposase_mut 427-550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788479.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	410	503	1.5e-18	67.7	MULE transposase domain
`XP_057788479.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	427	550	2.7e-10	40.4	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932496.1
ATGAAATGTGGCTTGGCCACAGACGATGACGTGGAAGCCTTGTTGGCAACTGCCGACTATCCCATGGTGTACGTTGAGCACTACAACAGTCCGATTGTAGAAGAAGCCTACATCCCTACTTTTGATTTTGCTGAACCTTCGGGACACGTAGATGAAGCACAATGCAGTCAGTATGAGACGCCGTATTATCATCATACGTCGTTTCATGGTGTCCAGAGCTCGCCTCCACGACAATATTTTACATGGGATGGACAACCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005490
ATGAAATGTGGCTTGGCCACAGACGATGACGTGGAAGCCTTGTTGGCAACTGCCGACTATCCCATGGTGTACGTTGAGCACTACAACAGTCCGATTGTAGAAGAAGCCTACATCCCTACTTTTGATTTTGCTGAACCTTCGGGACACGTAGATGAAGCACAATGCAGTCAGTATGAGACGCCGTATTATCATCATACGTCGTTTCATGGTGTCCAGAGCTCGCCTCCACGACAATATTTTACATGGGATGGACAACCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788479.1
MKCGLATDDDVEALLATADYPMVYVEHYNSPIVEEAYIPTFDFAEPSGHVDEAQCSQYETPYYHHTSFHGVQSSPPRQYFTWDGQPLDESAWNQTERLNEVCGRLNDVRTDDEPEHEAEGSVASGDDDDSEEDDEEFDPALAVGTASDASEDLLDDDLIDFTETERACWIRQSTTRDGDPTAETGDLTNWLVPLIPVDASASLVARESDPSRVDDLQKNSFYNSKDDLIIAVGLWNMKRGTETKVVRSDPGRVYFSCKHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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