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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005179`

染色体: Chr01 坐标: 69518197-69522787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005179`
名称	SmilChr01G005179
描述	protein XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69518197 - 69522787 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005514`
GeneID	`131005514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005514`
原始查询	`LOC131005514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER
产物	protein XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER
Arabidopsis	`AT2G21150` (XCT) XAP5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816650] identity=79.7; qcov=0.968; evalue=2.27e-133; confidence=high
Rice	`Os09g0535300` (XCT) - identity=83.2; qcov=0.961; evalue=1.71e-138; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006325 (chromatin organization)
KEGG	-
Pfam	PF04921 (XAP5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788507.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788508.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057788508.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788508.1`
5	Midbody	Midbody	0.20000	`XP_057788508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69518497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B24,C79
`Chr1:69518505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B105,B3,B57,C49
`Chr1:69518527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B12
`Chr1:69518561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:69518836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B104
`Chr1:69520395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:69520826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:69521029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr1:69522437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C68
`Chr1:69522437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788507.1

335 aa

168

335

XAP5

PF04921 XAP5 192-331 aa

XP_057788508.1

285 aa

142

285

XAP5

PF04921 XAP5 192-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788507.1`	Pfam	`PF04921`	XAP5	Domain	192	331	2.7e-53	181.2	XAP5, circadian clock regulator C-terminal domain
`XP_057788508.1`	Pfam	`PF04921`	XAP5	Domain	192	273	1.8e-26	94.1	XAP5, circadian clock regulator C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932524.1
ATAAATATGGTGACTTGAATGTAGCAAAATTAAAGGAATTTCACTCCAAAAATAAACAGGGGCTTTCATCTCCATAGTAGTCGCTCTTCCTCGTCTACGATTTATCTGTCGGAGCCCTAAATCCTAGTATCCCCAAATTCAACAAGAATTCCCTCTTCCGCAACTCTGCGTCGGATCCTTCGATAAATTCAAACCCTAATTTGCCGCTACATTCATACTCGTATTCAGCATGGCGGGTATGGGCGACGGCTACGTAGGCA...

XM_057932525.1
AAATATGGTGACTTGAATGTAGCAAAATTAAAGGAATTTCACTCCAAAAATAAACAGGGGCTTTCATCTCCATAGTAGTCGCTCTTCCTCGTCTACGATTTATCTGTCGGAGCCCTAAATCCTAGTATCCCCAAATTCAACAAGAATTCCCTCTTCCGCAACTCTGCGTCGGATCCTTCGATAAATTCAAACCCTAATTTGCCGCTACATTCATACTCGTATTCAGCATGGCGGGTATGGGCGACGGCTACGTAGGCACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005514
ATGGCGGGTATGGGCGACGGCTACGTAGGCACGGCGCAGGACGCCGTCAGGATCAGGCGGCTGGAGAAGCAGAGAGAGGCGGAGCGCCGCAAAATCCAAGAGCTTAAGAACAAAACCGCCGCTTCTGAAGGCCAGCCTGGCCTCCTCCAATTCGGCTCCAGTACCTCCGAGGTATTGGAGACTGCATTCAAGAAGGAAACTGTTGGTCTGGTCACCAGGGAGCAATATGTTGAGAAGAGAGTAAATATCAAGAATAAATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788507.1
MAGMGDGYVGTAQDAVRIRRLEKQREAERRKIQELKNKTAASEGQPGLLQFGSSTSEVLETAFKKETVGLVTREQYVEKRVNIKNKFEEEEKEKLLKLQQEEEELQLQKLKKRKIKADPRLSFADEFENDNEEEEEENQNDDIRQRFGKYGKDPTVETSFLPDSEREAEEQAERERLRKQWLLEQEQIKNEPLQITYSYWDGTGHRRVIQVRKGDAIGEFLRAVQQQLAPEFREVRTTSVENLLYVKEDLIIPHQHSFYE...

XP_057788508.1
MAGMGDGYVGTAQDAVRIRRLEKQREAERRKIQELKNKTAASEGQPGLLQFGSSTSEVLETAFKKETVGLVTREQYVEKRVNIKNKFEEEEKEKLLKLQQEEEELQLQKLKKRKIKADPRLSFADEFENDNEEEEEENQNDDIRQRFGKYGKDPTVETSFLPDSEREAEEQAERERLRKQWLLEQEQIKNEPLQITYSYWDGTGHRRVIQVRKGDAIGEFLRAVQQQLAPEFREVRTTSVENLLYVKEDLIIPHQHSFYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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