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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005190`

染色体: Chr01 坐标: 69598680-69627497 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005190`
名称	SmilChr01G005190
描述	COBRA-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69598680 - 69627497 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005525`
GeneID	`131005525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005525`
原始查询	`LOC131005525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COBRA-like protein 1
产物	COBRA-like protein 1
Arabidopsis	`AT3G02210` (COBL1) COBRA-like protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821245] identity=48.3; qcov=0.986; evalue=1.8e-141; confidence=high
Rice	`Os07g0604300` (BC1L6) - identity=45.7; qcov=1; evalue=1.48e-138; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010215 (cellulose microfibril organization); GO:0052324 (plant-type cell wall cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF04833 (COBRA_N); PF25079 (COB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788522.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057788523.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788522.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788522.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788522.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69598848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B135,C38,C52
`Chr1:69598894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B56,B96,C41
`Chr1:69598907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,B86,B9,C14,C33
`Chr1:69598924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:69599067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C8
`Chr1:69599652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:69599691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69600027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:69600041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B9
`Chr1:69600044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:69600077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:69600137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788522.1

440 aa

220

440

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 51-214 aa PF25079 COB_C 269-410 aa

XP_057788523.1

418 aa

209

418

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 29-192 aa PF25079 COB_C 247-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788522.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	51	214	9.1e-51	172.8	COBRA N-terminal domain
`XP_057788522.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	269	410	2.7e-40	139.4	COBRA family C-terminal domain
`XP_057788523.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	29	192	8.1e-51	173.0	COBRA N-terminal domain
`XP_057788523.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	247	388	3.9e-40	138.8	COBRA family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932540.1
ATGCTGCAGCTCGAGGGCAATCCCGTCTCGATCTCGATAAACTCGGTCGTCCACGAGCCGTTGGCGTCGTCCTCCACCCTCCTGCAGCCGTCGTCGCCGTGATCCGTGTACATACAACTCAACTGATGGAGACTTATTGCTACGACCCTTTGGATCCGAATGGAAACATCACAGTTACCTTCGACATATTCAAGTACAACAACGATGGCTACGTGGCAAGAGTGAGCATCCGAAACTACCATCAGTATCGTCACGTGGAG...

XM_057932539.1
ATTAACACTTAAAAACTTCATATCTTAATTATCTCATGTTCTTGTCATGCACTGAATTTTCAATTCTAACTTCAAATATATTGATGAGTGTCTTCATTCATTCTGTCTTTTTTTTCCCTCTATAAATCCAGATCTAACATTTTAATTCAAAAAACCACGTAAAAAACAAAAGAAGATTGTATGATTTAGACATTCAAAATTGCAAAATTGGACTAATATGCGCAATGGAACTGTTCGATAAAATGCCTGACAGAAACGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005525
ATGGAGACTTATTGCTACGACCCTTTGGATCCGAATGGAAACATCACAGTTACCTTCGACATATTCAAGTACAACAACGATGGCTACGTGGCAAGAGTGAGCATCCGAAACTACCATCAGTATCGTCACGTGGAGAGACCGGGTTGGAAGCTCGGGTGGTGGTGGGCGAGGGAGGAGGTTATCTTGGCGATTTCCGGAGGTGTTGCGACGAAACAAGGTGAATGCAAAGCTTCCACTGATGAAAAACCACATTGCTGCTC...

LOC131005525
ATGGTGTTGTTTACTCCATCAATGCAGCGTTACTTGTTGATGTTATTGTTGTCAGCTGCAGCTTCAAGAATTTCAGATTGCTACGACCCTTTGGATCCGAATGGAAACATCACAGTTACCTTCGACATATTCAAGTACAACAACGATGGCTACGTGGCAAGAGTGAGCATCCGAAACTACCATCAGTATCGTCACGTGGAGAGACCGGGTTGGAAGCTCGGGTGGTGGTGGGCGAGGGAGGAGGTTATCTTGGCGATTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788522.1
MVLFTPSMQRYLLMLLLSAAASRISDCYDPLDPNGNITVTFDIFKYNNDGYVARVSIRNYHQYRHVERPGWKLGWWWAREEVILAISGGVATKQGECKASTDEKPHCCSPDPEVVDLAPDATTDSRTDGCCHDGVLAAWAIDPPMSYSSFEITVGNLDQNRTGYLAPLNLTLTAPGPGYTCGPVREAPPTVSSVVGGRREEQVFRTWKSECTYSSYLSSKTPVCCVSLSTFYSPDITPCPSCSCGCRIADQSANSCISEG...

XP_057788523.1
METYCYDPLDPNGNITVTFDIFKYNNDGYVARVSIRNYHQYRHVERPGWKLGWWWAREEVILAISGGVATKQGECKASTDEKPHCCSPDPEVVDLAPDATTDSRTDGCCHDGVLAAWAIDPPMSYSSFEITVGNLDQNRTGYLAPLNLTLTAPGPGYTCGPVREAPPTVSSVVGGRREEQVFRTWKSECTYSSYLSSKTPVCCVSLSTFYSPDITPCPSCSCGCRIADQSANSCISEGAIPSNIPEAELVKCTDHMCPLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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