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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005199`

染色体: Chr01 坐标: 69674102-69681886 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005199`
名称	SmilChr01G005199
描述	pescadillo homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69674102 - 69681886 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005534`
GeneID	`131005534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005534`
原始查询	`LOC131005534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pescadillo homolog
产物	pescadillo homolog
Arabidopsis	`AT5G14520` (AT5G14520) pescadillo-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831303] identity=65; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0699200` (PES) - identity=63.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:0070545 (PeBoW complex)
KEGG	-
Pfam	PF00533 (BRCT); PF06732 (Pescadillo_N); PF16589 (BRCT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788529.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057788529.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057788529.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788529.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69674362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B36,B93
`Chr1:69674380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:69675351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B13,B22
`Chr1:69676011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:69676882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B48,C80,D2
`Chr1:69676932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B32,C37
`Chr1:69678931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B140,B36,B93
`Chr1:69679433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:69679473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69679571`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A24,A5,B1,B132,B29,B6,B81,B95,B98,C18,C2,C28,C51,C75
`Chr1:69679700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:69679703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788529.1

591 aa

296

591

Pescadillo_N

BRCT

BRCT_2

PF06732 Pescadillo_N 10-278 aa PF00533 BRCT 336-410 aa PF16589 BRCT_2 337-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788529.1`	Pfam	`PF06732`	Pescadillo_N	Family	10	278	5.9e-112	374.4	Pescadillo N-terminus
`XP_057788529.1`	Pfam	`PF00533`	BRCT	Domain	336	410	4.5e-05	24.3	BRCA1 C Terminus (BRCT) domain
`XP_057788529.1`	Pfam	`PF16589`	BRCT_2	Domain	337	421	6e-07	30.4	BRCT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932546.1
CTATTTAAAACTCTTTGAACCCTCGCCTCCTCTCTCTCTTCCTCTCCCCCTCTCTCTCATTCCCGCTGCTACAGACCTCCGCTTGCGGCCGCCATGCCGAAGCATTACCGCCCCGCCGGGAAGAAAAAGGAAGGAAACGCCGCTAAGTATGTGACCAGGTCGCAAGCTGTGAAATACCTCCAAGTTAGCCTTCCTGTATTCAGGAGACTATGTATCCTCAAAGGTGTATTTCCTCGGGAACCAAAGAAGAAGGTGAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005534
ATGCCGAAGCATTACCGCCCCGCCGGGAAGAAAAAGGAAGGAAACGCCGCTAAGTATGTGACCAGGTCGCAAGCTGTGAAATACCTCCAAGTTAGCCTTCCTGTATTCAGGAGACTATGTATCCTCAAAGGTGTATTTCCTCGGGAACCAAAGAAGAAGGTGAAGGGAAACCACCATTCTTATTATCACACGAAAGATCTCATGTTCCTTAAACATGAGCCCCTGCTTGAAAAATTCAGAGACATGCGCACTTATGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788529.1
MPKHYRPAGKKKEGNAAKYVTRSQAVKYLQVSLPVFRRLCILKGVFPREPKKKVKGNHHSYYHTKDLMFLKHEPLLEKFRDMRTYERKVKKAVSKKNRDLAERLLTRKPTYTLDMLIKERYPTFIDALRDLDDCLSMVHLFAALPAVDRIVDGEKIPVSRVHNCRRLSQEWQAYISRTHKLRKTFISVKGIYYQAEVEGQKVTWLTPHALQQVLPEVDYRVLLTFLEFYETLLGFVNHRLYQSINATYPPILDPRLEALS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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