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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005213`

染色体: Chr01 坐标: 69742758-69744892 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005213`
名称	SmilChr01G005213
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g13965
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69742758 - 69744892 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005547`
GeneID	`131005547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005547`
原始查询	`LOC131005547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g13965
产物	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g13965
Arabidopsis	`AT4G13965` (AT4G13965) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827031] identity=28.3; qcov=0.557; evalue=5.88e-17; confidence=low
Rice	`Os08g0281600` (OsFBX283) - identity=25.4; qcov=0.782; evalue=4.64e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788542.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788542.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788542.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788542.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69743060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B5,C20,D4
`Chr1:69743325`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B137
`Chr1:69743325`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B137
`Chr1:69743356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B95
`Chr1:69743371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B95
`Chr1:69743419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B140,C41
`Chr1:69743419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C41
`Chr1:69743441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:69743452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B122
`Chr1:69743456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B122
`Chr1:69743476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B122
`Chr1:69743478`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A8,B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788542.1

413 aa

206

413

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF00646 F-box 18-56 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 79-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788542.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	18	56	7e-07	29.6	F-box domain
`XP_057788542.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	79	249	7.4e-14	52.6	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932559.1
AATTTTTAATTAGGATTTATACCTCAATTATAATTTTGGATTTGGGCGGATTGAGGATTTAGGGATTAGGGATCAATATTTAAGTCGAGACCGTCTCCGACTCTAATAATTCGGCTGGAACCAAACGACAGAATCTTGAAATTGATTGAAGTAGTGATGGACGATTCAGATTTTCTGCCCAAGAAGTCTTCTCGGAGATGCGATAGGATTAGTGAGTTGCCTGATGAAATTATCCTCGTCATATTGTCTTTCCTATCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005547
ATGGACGATTCAGATTTTCTGCCCAAGAAGTCTTCTCGGAGATGCGATAGGATTAGTGAGTTGCCTGATGAAATTATCCTCGTCATATTGTCTTTCCTATCACTGAGGGAATCTGTAACCACTAGTGTTCTCTCTTCCCGATGGTCGGATTTGTGGAAACACACTCCTAATCTCAACTTGGATGCGAAGCTTCTAACCAACCGCTATAAGAAGCCCATAGAAATAATAAACTCGGTTCTCCAATCGCATAAAGCCCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788542.1
MDDSDFLPKKSSRRCDRISELPDEIILVILSFLSLRESVTTSVLSSRWSDLWKHTPNLNLDAKLLTNRYKKPIEIINSVLQSHKAPSLKEFRISVYANYLEQRAVAKWLEFVVSRQVERLELNLLGTELEVPIFKVSLLELLRERPQNLIGFKSLKSLCLKGFIVSGEVIDSFLRNCPLLKQLDIHSSTLTSDVVICGTALALEELDIYRCAGQCSIQVSAPNLTWLRVHSTSQILLACAVFSCISRLKTLSLTIRRPKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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