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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005230`

染色体: Chr01 坐标: 69858640-69900672 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005230`
名称	SmilChr01G005230
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69858640 - 69900672 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005561`
GeneID	`131005561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005561`
原始查询	`LOC131005561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT1G78760` (AT1G78760) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844212] identity=23.5; qcov=1.02; evalue=2.72e-18; confidence=weak
Rice	`Os07g0285200` (OsFbox363) - identity=27.7; qcov=0.46; evalue=9.29e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788552.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788552.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788552.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788552.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69858942`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr1:69858942`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr1:69858948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:69858956`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A5,B123,B139,B21,B23,B27,B41,B66,B86,B9,B90,B92,C11,C17,C41,C69,C86,D10
`Chr1:69858959`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A5,B123,B139,B21,B23,B27,B41,B66,B86,B9,B90,B92,C11,C17,C41,C69,C86,D10
`Chr1:69858978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D11
`Chr1:69859039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C1
`Chr1:69859131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:69859139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:69859158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B59,C1,C31
`Chr1:69859217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B140,B36,B93,C33
`Chr1:69859237`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B110,B59,C1,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788552.1

502 aa

251

502

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 4-43 aa PF24758 LRR_At5g56370 111-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788552.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	43	6.2e-05	23.5	F-box domain
`XP_057788552.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	111	243	2.3e-16	60.8	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932569.1
GTGAAATACGTGTGTTACACGCTATATTGTGGGACCAAGGATCTCACAAGCTCGAACGAGGGTTTTTCGGGCTGAAGCAACCGCCACGGCAAAGCTTTAATTTTGAGACTTGTAGATCTAGATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGATTCTGTAATATTTCACATATTCTGGTTGTTGCCGATGAGCGATGTTGTTAGAACTACAATTTTATCTAAGAGATGGAAAAACCTCTGGACCACCACCCCCTTCCTCAATTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005561
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGATTCTGTAATATTTCACATATTCTGGTTGTTGCCGATGAGCGATGTTGTTAGAACTACAATTTTATCTAAGAGATGGAAAAACCTCTGGACCACCACCCCCTTCCTCAATTTCGACAATTATACGGTTTCGTTTGATGACACAGATAGGCTAGTAAACTTTGTTAATCAGGCTTTATTGAAGTGGAATGGGGTTAGGGTTCTGAAATTGAAGCTTGATTCGTGGGATGGGCTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788552.1
MDRLSELPDSVIFHIFWLLPMSDVVRTTILSKRWKNLWTTTPFLNFDNYTVSFDDTDRLVNFVNQALLKWNGVRVLKLKLDSWDGLLEAAMFGEIDSCYGFNESRVSGYIHSWLRFAMLNKVEELYMHMELQIVSLTEYDFDYKLQTYWVPPYVYECSSLKVLSLRHCLLRFDGNVQWNQLKSLTIDNGCVDENVMNLILSGSPLLEVLILSLIEGCESLCIRSSSLKVLSINKYLSDGDSHDYLSLDSLASELRIWALN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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