当前解析结果
SmilChr01G001443| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001443 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001443 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001443 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 28133035 - 28134477 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005564 |
|---|---|
| GeneID | 131005564 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005564 |
| 原始查询 | LOC131005564 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005564 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788560.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788560.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788560.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788560.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057788560.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:28133051 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C11,C53,C69 |
Chr1:28133065 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr1:28133067 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr1:28133105 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr1:28133112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C78 |
Chr1:28133112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr1:28133142 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B7,C69 |
Chr1:28133142 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B7,C69 |
Chr1:28133149 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C4,C63 |
Chr1:28133151 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,D7 |
Chr1:28133196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C32,C66,C77 |
Chr1:28133199 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A11,A22,B114,B23,B47,B83,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。