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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005235`

染色体: Chr01 坐标: 69928344-69928864 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005235`
名称	SmilChr01G005235
描述	auxin-induced protein 15A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69928344 - 69928864 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005565`
GeneID	`131005565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005565`
原始查询	`LOC131005565`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-induced protein 15A-like
产物	auxin-induced protein 15A-like
Arabidopsis	`AT2G21210` (AT2G21210) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816658] identity=54.2; qcov=1.09; evalue=1.41e-33; confidence=medium
Rice	`Os08g0118500` (OsSAUR31) - identity=66.1; qcov=0.67; evalue=1.05e-20; confidence=low
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788557.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788557.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788557.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788557.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69928471`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B86,C1
`Chr1:69928471`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B86,C1
`Chr1:69928475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B129,B2,D11
`Chr1:69928554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:69928555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr1:69928556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B36,C33
`Chr1:69928577`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A20,A21,A4,B10,B105,B108,B109,B111,B113,B119,B121,B122,B128,B13,B136,B140,B16,B2,B20,B26,B28,B36,B40,B52,B56,B63,B70,B86,B9,B92,C1,C12,C15,C16,C2,C23,C3,C33,C37,C43,C48,C78,D2,D8
`Chr1:69928592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,C11,C41,C69
`Chr1:69928610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B52,B56,C48,D2
`Chr1:69928634`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	163	A1,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B107,B108,B109,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B138,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B36,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B50,B51,B53,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B71,B75,B76,B77,B79,B8,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,C10,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C36,C37,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C53,C54,C57,C59,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C74,C78,C8,C84,C85,C87,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr1:69928640`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	146	A1,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A21,A3,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B107,B108,B109,B111,B112,B114,B115,B119,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B138,B14,B140,B18,B20,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B36,B4,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B50,B51,B53,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B64,B65,B68,B69,B7,B71,B75,B76,B77,B79,B8,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B96,B97,B98,C10,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C20,C22,C23,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C36,C37,C39,C41,C42,C44,C45,C48,C53,C54,C57,C59,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C74,C78,C84,C85,C87,D11,D2,D5,D7,D8
`Chr1:69928682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,C11,C41,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788557.1

88 aa

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 9-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788557.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	9	86	1.2e-24	87.1	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932574.1
AAACACAATTCTCATCTTCAACCATCAACAAGCCTTCTTTAGCTCTCTTCTTGATTTTGATTTCTTTCACAACTACTTGATAGAAAGAAAATAAAAAACTCTCATTTCACTTACTTGATTTGCTACACGATGGCCATTCGCCAAATGCTGAGGCGGTCTTTGTCCAGCGAGAGAAGGTCAGCCGAAGTTCCCAAGGGGCATGTTGCTGTTTATGTTGGAGATAATGAAAAGAAGCGGTTTGTGATTCCAGTGGCGTACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005565
ATGGCCATTCGCCAAATGCTGAGGCGGTCTTTGTCCAGCGAGAGAAGGTCAGCCGAAGTTCCCAAGGGGCATGTTGCTGTTTATGTTGGAGATAATGAAAAGAAGCGGTTTGTGATTCCAGTGGCGTACTTGAACCACCCCTCGTTTCAAGAGTTGTTGTTTCAAGCTGAGGAAGAATTCGGGTTCAATCACCCGATGGGCGGCCTCACCATCCCTTGCAGTCAAGAATTATTTGTAGATTTCATCTCTGCCTTCAGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788557.1
MAIRQMLRRSLSSERRSAEVPKGHVAVYVGDNEKKRFVIPVAYLNHPSFQELLFQAEEEFGFNHPMGGLTIPCSQELFVDFISAFSSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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